35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4397 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1254    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  36.14 
 
 		 543 aa  258  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  31.4 
 
 		 267 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  27.72 
 
 		 311 aa  91.3  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  27.06 
 
 		 295 aa  90.5  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  26.62 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  26.14 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  26.32 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  26.59 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  25.68 
 
 		 297 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  25.75 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  26.39 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  25.54 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  25.28 
 
 		 333 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  25.19 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  25 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  24.63 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  23.37 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  25.38 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  24.21 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  25.28 
 
 		 322 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  24.71 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  24.44 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  24.52 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  25 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  24.34 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  26.72 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  25.28 
 
 		 303 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  24.72 
 
 		 277 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  24.72 
 
 		 277 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  24.72 
 
 		 277 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  24.57 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  22.95 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1098 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  23.86 
 
 		 1094 aa  44.3  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>