31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0282 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  588  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3553  hypothetical protein  34.96 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2921  hypothetical protein  28.16 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  28.42 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  27.44 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  27.44 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  27.44 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  27.34 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2029  hypothetical protein  28.19 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  23.51 
 
 		 322 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  25.46 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1073  hypothetical protein  23.98 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0101228  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  26.57 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  24.15 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  25.32 
 
 		 387 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  22.85 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  22.64 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  22.26 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0476  hypothetical protein  23.89 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000953683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  23.51 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  24.53 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  22.3 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  22.14 
 
 		 267 aa  45.4  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  22.79 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  22.71 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  23.25 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  22.18 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  21.48 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2030  hypothetical protein  40.82 
 
 		 105 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  33.68 
 
 		 1129 aa  42  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>