96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0636 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  779    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  89.66 
 
 
387 aa  678    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  96.38 
 
 
387 aa  755    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  89.41 
 
 
387 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  88.89 
 
 
387 aa  673    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  89.15 
 
 
387 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  94.06 
 
 
387 aa  708    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  31.05 
 
 
379 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  27.3 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  29.05 
 
 
379 aa  109  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 
1019 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  28.57 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  29.17 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  29.66 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  28.9 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  29.55 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  28.52 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  29.7 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  27.97 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  28.57 
 
 
323 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  30.5 
 
 
286 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  30.43 
 
 
276 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  26.59 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  29.66 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  29.66 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2921  hypothetical protein  26.74 
 
 
274 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  26.05 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  27.27 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  27.59 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  29.18 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  28.19 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  28.4 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  27.92 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  25.31 
 
 
1052 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  29.66 
 
 
297 aa  67  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.54 
 
 
1016 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  27.44 
 
 
299 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  28.52 
 
 
302 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  27.67 
 
 
259 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  28.83 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  28.85 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  24.62 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  26.17 
 
 
273 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  27.05 
 
 
286 aa  63.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  27.31 
 
 
277 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  27.31 
 
 
277 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  27.31 
 
 
277 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  27.92 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  28.63 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  27.89 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  27.69 
 
 
303 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.43 
 
 
1124 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  30.91 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  25.91 
 
 
320 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  26.92 
 
 
333 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  26.19 
 
 
287 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3553  hypothetical protein  27.72 
 
 
279 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912866  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  22.96 
 
 
276 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 
1051 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 
1051 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 
1051 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  24.22 
 
 
263 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  26.18 
 
 
543 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  25.96 
 
 
306 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  27.24 
 
 
921 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  29.73 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  29.87 
 
 
993 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  27.64 
 
 
1134 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 
1062 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  29.22 
 
 
991 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  30.23 
 
 
1098 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  27.63 
 
 
786 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  24.27 
 
 
920 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  30.5 
 
 
1197 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  24.8 
 
 
1060 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 
1059 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.68 
 
 
1058 aa  47.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 
1074 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.75 
 
 
781 aa  46.6  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.43 
 
 
1066 aa  46.2  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  39.34 
 
 
1095 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 
1038 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5413  hypothetical protein  28.5 
 
 
886 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.871624  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  26.03 
 
 
1066 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  31.9 
 
 
1048 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  27.56 
 
 
1055 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  26.89 
 
 
263 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  25.1 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  40.43 
 
 
940 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  27.66 
 
 
865 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 
1038 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  26.5 
 
 
366 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.49 
 
 
989 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  30.41 
 
 
1076 aa  43.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1737  phage NTP-binding protein  21.8 
 
 
530 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  29.95 
 
 
1029 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>