95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0735 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  100 
 
 		 781 aa  1571    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  61.33 
 
 		 783 aa  909    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  42.84 
 
 		 803 aa  561  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  41.09 
 
 		 786 aa  533  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  40.3 
 
 		 788 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  40.3 
 
 		 788 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  40.05 
 
 		 788 aa  472  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  38.15 
 
 		 794 aa  464  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 781 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  33.04 
 
 		 780 aa  368  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  26.32 
 
 		 984 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  23.52 
 
 		 919 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1100 aa  73.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  25.53 
 
 		 951 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  26.38 
 
 		 997 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  22.28 
 
 		 976 aa  70.5  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  30.46 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  23.31 
 
 		 1064 aa  67.8  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  22.37 
 
 		 1062 aa  66.6  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  22.09 
 
 		 991 aa  65.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  22.97 
 
 		 1064 aa  64.7  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  22.49 
 
 		 968 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1000 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.02 
 
 		 958 aa  63.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1039 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  28.9 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  28.9 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  28.9 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  27.62 
 
 		 291 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  24.03 
 
 		 988 aa  59.7  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  23.32 
 
 		 993 aa  58.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  21.69 
 
 		 1052 aa  58.9  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  27.64 
 
 		 1016 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  23.93 
 
 		 912 aa  58.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  29.14 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  22.57 
 
 		 913 aa  57.8  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  24.61 
 
 		 266 aa  57  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  24.42 
 
 		 286 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.3 
 
 		 957 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  22.04 
 
 		 1047 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  21.66 
 
 		 1045 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  20.15 
 
 		 951 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  22.09 
 
 		 1037 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  24.35 
 
 		 311 aa  55.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  19.87 
 
 		 947 aa  54.7  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  24.84 
 
 		 997 aa  54.3  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  22.08 
 
 		 1054 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  21.85 
 
 		 1059 aa  53.9  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  21.97 
 
 		 1047 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 		 267 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  19.87 
 
 		 1052 aa  53.5  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  20 
 
 		 962 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  25.97 
 
 		 1041 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  23.89 
 
 		 997 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  22.32 
 
 		 896 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  19.13 
 
 		 911 aa  52.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  22.32 
 
 		 977 aa  52.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  25.14 
 
 		 1047 aa  52.4  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  24.53 
 
 		 297 aa  52.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  23.86 
 
 		 295 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  21.35 
 
 		 960 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.15 
 
 		 1048 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  22.96 
 
 		 273 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  20.13 
 
 		 986 aa  52  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  19.87 
 
 		 1052 aa  52  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  20.06 
 
 		 957 aa  51.6  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  22.06 
 
 		 909 aa  50.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  23.36 
 
 		 1015 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  26.67 
 
 		 333 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  22.35 
 
 		 280 aa  49.3  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1042 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.42 
 
 		 940 aa  48.9  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  21.05 
 
 		 1040 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  22.47 
 
 		 1000 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  22.81 
 
 		 302 aa  48.5  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  26.16 
 
 		 284 aa  48.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  25.86 
 
 		 306 aa  47.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.03 
 
 		 916 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  26.38 
 
 		 287 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  23.14 
 
 		 387 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  21.34 
 
 		 1019 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  23.86 
 
 		 312 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  20.91 
 
 		 864 aa  45.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  27.43 
 
 		 323 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  23.22 
 
 		 1048 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  24.53 
 
 		 379 aa  45.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1048 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  25.1 
 
 		 855 aa  44.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  29.14 
 
 		 295 aa  44.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.38 
 
 		 906 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  18.81 
 
 		 994 aa  44.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  25.2 
 
 		 856 aa  44.3  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  23.12 
 
 		 293 aa  44.3  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  21.89 
 
 		 294 aa  44.3  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  23.81 
 
 		 922 aa  44.3  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>