72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4065 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  100 
 
 
986 aa  1955    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  43.69 
 
 
988 aa  713    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  47.02 
 
 
977 aa  805    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  49.03 
 
 
1000 aa  817    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  48.94 
 
 
997 aa  812    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  48.94 
 
 
997 aa  815    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  42.01 
 
 
980 aa  609  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  36.93 
 
 
1001 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.4 
 
 
1042 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  32.03 
 
 
1052 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  32.79 
 
 
1052 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  32.89 
 
 
1052 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  33.87 
 
 
1053 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  32.95 
 
 
1049 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  33.93 
 
 
1047 aa  363  8e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  33.97 
 
 
1047 aa  363  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  34.57 
 
 
1018 aa  362  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  34 
 
 
1045 aa  361  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  33.09 
 
 
1049 aa  357  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  33.43 
 
 
999 aa  355  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  32.98 
 
 
1049 aa  353  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  31.72 
 
 
1064 aa  352  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  32.58 
 
 
1059 aa  351  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  34.64 
 
 
1015 aa  349  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  32.95 
 
 
1048 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  30.67 
 
 
1047 aa  342  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.82 
 
 
1048 aa  340  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  31.45 
 
 
1076 aa  339  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  31.73 
 
 
1064 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  31.76 
 
 
1043 aa  337  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  31.99 
 
 
1062 aa  332  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  32.75 
 
 
1016 aa  326  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  33.08 
 
 
1037 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  32.26 
 
 
1042 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  33.63 
 
 
991 aa  317  9e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  32.59 
 
 
1054 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  31.1 
 
 
993 aa  310  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  31.72 
 
 
1040 aa  292  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  32.63 
 
 
1014 aa  291  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  32.68 
 
 
991 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  31.79 
 
 
959 aa  222  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  20.04 
 
 
914 aa  115  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  19.93 
 
 
911 aa  102  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.29 
 
 
890 aa  94  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  29.61 
 
 
864 aa  65.1  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  24.77 
 
 
947 aa  62.4  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.48 
 
 
836 aa  59.3  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.58 
 
 
803 aa  58.5  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  25.24 
 
 
976 aa  58.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  30 
 
 
779 aa  58.2  0.0000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  32.43 
 
 
846 aa  56.6  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  20.75 
 
 
781 aa  54.3  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  30.11 
 
 
962 aa  53.5  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  29.25 
 
 
299 aa  53.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  27.59 
 
 
883 aa  53.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  26.22 
 
 
915 aa  50.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  27.75 
 
 
990 aa  48.5  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  27.86 
 
 
273 aa  48.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  28.45 
 
 
855 aa  48.1  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  27.33 
 
 
277 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.61 
 
 
958 aa  47.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  27.33 
 
 
277 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  27.33 
 
 
277 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.17 
 
 
957 aa  47.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0781  hypothetical protein  27.13 
 
 
886 aa  47  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384751  normal  0.165581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  29.82 
 
 
297 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  27.85 
 
 
280 aa  47  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  23.19 
 
 
780 aa  46.2  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  26.14 
 
 
1040 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  27.83 
 
 
856 aa  45.8  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  29.41 
 
 
896 aa  45.8  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  26.09 
 
 
291 aa  45.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>