57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1306 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  100 
 
 		 994 aa  2045    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  75.03 
 
 		 991 aa  1551    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  30.23 
 
 		 962 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  28.28 
 
 		 951 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  28.95 
 
 		 947 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.64 
 
 		 957 aa  362  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  29.35 
 
 		 976 aa  327  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  28.09 
 
 		 856 aa  178  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  26.06 
 
 		 856 aa  177  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  26.06 
 
 		 856 aa  175  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.33 
 
 		 836 aa  173  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  27.99 
 
 		 846 aa  172  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  28.34 
 
 		 864 aa  170  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  26.62 
 
 		 883 aa  167  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  27.11 
 
 		 855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.07 
 
 		 958 aa  145  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.22 
 
 		 915 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  28.41 
 
 		 940 aa  134  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1052 aa  73.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  23.42 
 
 		 1052 aa  72.8  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  22.26 
 
 		 1052 aa  71.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  23.45 
 
 		 1059 aa  68.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  23.1 
 
 		 908 aa  67.4  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.14 
 
 		 1042 aa  65.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  21.51 
 
 		 951 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  25 
 
 		 1037 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  23.08 
 
 		 1040 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  23.17 
 
 		 1062 aa  60.1  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  24.03 
 
 		 993 aa  60.1  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  23 
 
 		 1047 aa  60.1  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  21.39 
 
 		 1054 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  23.24 
 
 		 984 aa  58.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  22.26 
 
 		 1045 aa  58.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1100 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.74 
 
 		 968 aa  55.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1049 aa  55.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  21.46 
 
 		 1047 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  22.46 
 
 		 1047 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  25.33 
 
 		 959 aa  53.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1049 aa  53.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  23.58 
 
 		 1076 aa  53.5  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  25.11 
 
 		 990 aa  53.1  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  24.12 
 
 		 1043 aa  52.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1000 aa  52  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  28.11 
 
 		 896 aa  51.6  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  22.8 
 
 		 1064 aa  49.7  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08480  RecB family exonuclease  25.11 
 
 		 889 aa  49.7  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1048 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.33 
 
 		 1048 aa  49.3  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1016 aa  47  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.56 
 
 		 989 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1042 aa  46.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  23.28 
 
 		 999 aa  45.8  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  23.06 
 
 		 1014 aa  45.8  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  22.89 
 
 		 1064 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  22.92 
 
 		 988 aa  45.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  24.64 
 
 		 997 aa  44.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>