29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2356 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  53.21 
 
 		 864 aa  743    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  98.83 
 
 		 856 aa  1639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  52.64 
 
 		 846 aa  733    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  52.34 
 
 		 856 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  59.59 
 
 		 883 aa  885    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  50.4 
 
 		 855 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  100 
 
 		 856 aa  1660    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  57.13 
 
 		 940 aa  756    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  40.58 
 
 		 915 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  33.54 
 
 		 947 aa  235  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  33.43 
 
 		 951 aa  231  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  35.01 
 
 		 962 aa  230  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  32.01 
 
 		 976 aa  210  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.11 
 
 		 957 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  28.32 
 
 		 991 aa  188  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  34.93 
 
 		 836 aa  187  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  26.34 
 
 		 994 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.55 
 
 		 958 aa  143  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  25.72 
 
 		 865 aa  55.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.1 
 
 		 989 aa  54.3  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.34 
 
 		 968 aa  52.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.58 
 
 		 1019 aa  51.2  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  28.57 
 
 		 991 aa  49.7  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  26.55 
 
 		 990 aa  48.5  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  34.69 
 
 		 1042 aa  48.5  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  27.55 
 
 		 1076 aa  48.1  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  27.26 
 
 		 1049 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  25.39 
 
 		 1000 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  24.79 
 
 		 922 aa  45.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>