91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2115 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  55.4 
 
 		 962 aa  902    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  55.18 
 
 		 951 aa  916    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  100 
 
 		 957 aa  1887    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  55.14 
 
 		 947 aa  915    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  73.47 
 
 		 976 aa  1316    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  29.88 
 
 		 991 aa  386  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  30.01 
 
 		 994 aa  356  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  34.33 
 
 		 855 aa  248  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  33.13 
 
 		 864 aa  238  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.13 
 
 		 836 aa  235  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.38 
 
 		 915 aa  235  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  31.76 
 
 		 856 aa  225  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.68 
 
 		 958 aa  220  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  32.98 
 
 		 846 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  32.05 
 
 		 856 aa  212  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  32.34 
 
 		 856 aa  208  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  31.47 
 
 		 883 aa  168  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  30.74 
 
 		 940 aa  157  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  25.98 
 
 		 1062 aa  100  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1049 aa  97.8  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  29.49 
 
 		 993 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  27.52 
 
 		 1059 aa  96.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1048 aa  92  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  26.69 
 
 		 1052 aa  91.7  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  26.31 
 
 		 1049 aa  91.3  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.29 
 
 		 1042 aa  90.5  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  27.29 
 
 		 1064 aa  89.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  26.86 
 
 		 1064 aa  88.2  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  28.07 
 
 		 1037 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  26.51 
 
 		 1043 aa  82.4  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  26.22 
 
 		 1040 aa  81.6  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  25.04 
 
 		 1047 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  28.57 
 
 		 1054 aa  81.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1053 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  25.04 
 
 		 1047 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  25 
 
 		 1045 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1052 aa  74.3  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  27.11 
 
 		 991 aa  72.8  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  24.52 
 
 		 1001 aa  73.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  25.38 
 
 		 1052 aa  71.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  26.77 
 
 		 959 aa  70.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  25.94 
 
 		 1047 aa  69.7  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1100 aa  68.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.83 
 
 		 1048 aa  68.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  25.87 
 
 		 1049 aa  68.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1042 aa  68.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1018 aa  67  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  26.3 
 
 		 1076 aa  66.6  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.37 
 
 		 1049 aa  63.9  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  26.87 
 
 		 991 aa  64.3  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  24.79 
 
 		 999 aa  63.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  21.54 
 
 		 781 aa  61.6  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  26.71 
 
 		 865 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  25.39 
 
 		 988 aa  59.3  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  24.69 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  31.03 
 
 		 1029 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25 
 
 		 1048 aa  56.6  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  21.7 
 
 		 858 aa  55.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  27.46 
 
 		 1015 aa  55.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  20.3 
 
 		 781 aa  55.8  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  22.28 
 
 		 780 aa  55.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  20.59 
 
 		 858 aa  53.9  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.64 
 
 		 989 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.26 
 
 		 994 aa  54.3  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  24.72 
 
 		 1038 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1100 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  24.84 
 
 		 990 aa  53.5  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  19.22 
 
 		 960 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  25.82 
 
 		 1077 aa  52.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1151 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  25 
 
 		 1016 aa  52.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  17.71 
 
 		 803 aa  50.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  17.35 
 
 		 786 aa  50.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  25.86 
 
 		 1000 aa  50.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  25.13 
 
 		 1014 aa  49.7  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 1051 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  26.67 
 
 		 997 aa  48.9  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  23.26 
 
 		 984 aa  48.9  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  18.4 
 
 		 794 aa  48.5  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  22.32 
 
 		 951 aa  48.9  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.64 
 
 		 1029 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  26.85 
 
 		 997 aa  47.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  21.75 
 
 		 783 aa  47  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 1099 aa  47  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  23.11 
 
 		 896 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  23.56 
 
 		 997 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  26.74 
 
 		 1051 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  26.74 
 
 		 1051 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  24.92 
 
 		 980 aa  45.8  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1079 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  30.57 
 
 		 297 aa  44.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>