49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2195 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  97.67 
 
 		 858 aa  1707    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  100 
 
 		 858 aa  1762    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  28.41 
 
 		 911 aa  365  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  26.86 
 
 		 930 aa  318  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  26.7 
 
 		 913 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  28.99 
 
 		 872 aa  304  5.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  28.65 
 
 		 862 aa  303  7.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  27.35 
 
 		 896 aa  282  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.84 
 
 		 906 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.35 
 
 		 916 aa  267  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  26.53 
 
 		 912 aa  261  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  28.31 
 
 		 922 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.52 
 
 		 940 aa  195  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.76 
 
 		 935 aa  187  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  21.64 
 
 		 908 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  22.1 
 
 		 780 aa  64.7  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  22.83 
 
 		 976 aa  63.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  24.32 
 
 		 951 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  23.53 
 
 		 1037 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  21.04 
 
 		 865 aa  60.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  20.88 
 
 		 911 aa  58.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  21.98 
 
 		 969 aa  55.8  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  21.98 
 
 		 969 aa  55.8  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.9 
 
 		 836 aa  54.7  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.59 
 
 		 957 aa  54.7  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  22.31 
 
 		 1047 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.47 
 
 		 958 aa  53.9  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  22.94 
 
 		 1047 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.52 
 
 		 803 aa  51.6  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  21.46 
 
 		 962 aa  51.2  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  22.02 
 
 		 984 aa  51.2  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  20.39 
 
 		 1049 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  22.11 
 
 		 788 aa  48.9  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  23.17 
 
 		 1062 aa  48.9  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  22.93 
 
 		 1054 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  29.15 
 
 		 990 aa  48.9  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  21.29 
 
 		 1045 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  21.81 
 
 		 951 aa  48.5  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  20.47 
 
 		 781 aa  47.8  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.77 
 
 		 1169 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  21.91 
 
 		 788 aa  47.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  21.95 
 
 		 1040 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  21.85 
 
 		 788 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  28.99 
 
 		 919 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  20.93 
 
 		 1049 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  23.98 
 
 		 1146 aa  46.2  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1039 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.33 
 
 		 1121 aa  45.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  21.67 
 
 		 909 aa  44.3  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>