19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2004 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  100 
 
 		 935 aa  1924    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  27.64 
 
 		 896 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.52 
 
 		 916 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  27.25 
 
 		 912 aa  235  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  26.28 
 
 		 913 aa  232  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  25.03 
 
 		 872 aa  218  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  25.22 
 
 		 911 aa  213  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  24.63 
 
 		 930 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  24.87 
 
 		 862 aa  213  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.23 
 
 		 906 aa  211  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  26.23 
 
 		 858 aa  193  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  26.09 
 
 		 858 aa  186  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  27.09 
 
 		 922 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.57 
 
 		 940 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  21.22 
 
 		 951 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  22.69 
 
 		 1037 aa  54.7  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.18 
 
 		 1149 aa  48.1  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  23.6 
 
 		 993 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  25.74 
 
 		 1062 aa  44.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>