80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1392 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  100 
 
 		 803 aa  1603    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  42.84 
 
 		 781 aa  561  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  40.17 
 
 		 783 aa  515  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  40.88 
 
 		 786 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  37.59 
 
 		 788 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  37.59 
 
 		 788 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  37.23 
 
 		 788 aa  445  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  36.55 
 
 		 794 aa  436  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  32.56 
 
 		 780 aa  365  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  29.63 
 
 		 781 aa  307  6e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  25.44 
 
 		 912 aa  85.9  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  20.37 
 
 		 984 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1100 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  22.16 
 
 		 997 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  24.15 
 
 		 846 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  21.53 
 
 		 968 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  19.5 
 
 		 988 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1000 aa  70.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.54 
 
 		 958 aa  70.5  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  22.22 
 
 		 951 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  21.13 
 
 		 911 aa  69.3  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1039 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  20.73 
 
 		 991 aa  68.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  19.05 
 
 		 896 aa  65.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  20.92 
 
 		 977 aa  65.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.96 
 
 		 916 aa  62.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  19.85 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  22.69 
 
 		 919 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.76 
 
 		 940 aa  60.8  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  19.92 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  20.14 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  21.18 
 
 		 993 aa  57.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  21.3 
 
 		 865 aa  57.8  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  24.32 
 
 		 277 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  24.32 
 
 		 277 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  24.32 
 
 		 277 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  20.24 
 
 		 986 aa  56.6  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  23.16 
 
 		 333 aa  55.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  20.34 
 
 		 864 aa  55.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  20.06 
 
 		 1052 aa  55.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  20.57 
 
 		 291 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  21.61 
 
 		 960 aa  54.7  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  22.12 
 
 		 855 aa  54.3  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  20.06 
 
 		 1052 aa  53.5  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 		 311 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  29.27 
 
 		 379 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.67 
 
 		 1048 aa  53.9  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  28 
 
 		 379 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  21.11 
 
 		 1048 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  19.83 
 
 		 976 aa  53.5  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  28 
 
 		 379 aa  52.8  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  21.82 
 
 		 278 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  23.16 
 
 		 351 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  20.43 
 
 		 856 aa  51.6  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  28.09 
 
 		 267 aa  51.6  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  21.52 
 
 		 858 aa  52  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  22.76 
 
 		 263 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  19.79 
 
 		 957 aa  51.2  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  17.71 
 
 		 957 aa  51.2  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  19.47 
 
 		 930 aa  51.2  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  28.14 
 
 		 1016 aa  50.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  22.12 
 
 		 858 aa  50.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  20.39 
 
 		 1066 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  20.58 
 
 		 947 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  20.49 
 
 		 862 aa  50.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  19.78 
 
 		 273 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  20.49 
 
 		 872 aa  49.7  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  20.7 
 
 		 295 aa  49.3  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  19.7 
 
 		 299 aa  48.9  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  19.48 
 
 		 951 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.54 
 
 		 1048 aa  48.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  19.68 
 
 		 962 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0632  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00702425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  18.9 
 
 		 913 aa  46.6  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  20.47 
 
 		 969 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  20.47 
 
 		 969 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  21.8 
 
 		 297 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1578  hypothetical protein  23.03 
 
 		 753 aa  45.4  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  16.92 
 
 		 989 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1561  hypothetical protein  19.46 
 
 		 876 aa  44.3  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.595099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>