66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1752 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  100 
 
 		 940 aa  1885    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  43.19 
 
 		 912 aa  611  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  35.15 
 
 		 911 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  32.93 
 
 		 896 aa  369  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  31.46 
 
 		 913 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  31.44 
 
 		 930 aa  361  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.54 
 
 		 916 aa  351  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  29.41 
 
 		 922 aa  332  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.47 
 
 		 906 aa  321  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  26.1 
 
 		 872 aa  301  3e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  25.88 
 
 		 862 aa  296  9e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  23.52 
 
 		 858 aa  207  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  23.4 
 
 		 858 aa  204  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.58 
 
 		 935 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  27.35 
 
 		 993 aa  73.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  26.87 
 
 		 991 aa  72  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  23.72 
 
 		 803 aa  72  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  22.89 
 
 		 969 aa  64.3  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  22.89 
 
 		 969 aa  64.3  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  24.85 
 
 		 991 aa  63.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  24.06 
 
 		 1052 aa  62.4  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  26.26 
 
 		 988 aa  62  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  23.73 
 
 		 908 aa  61.6  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  28.77 
 
 		 997 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.68 
 
 		 781 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  25.68 
 
 		 1064 aa  58.9  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  24.28 
 
 		 780 aa  58.5  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  32.31 
 
 		 259 aa  56.6  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  27.75 
 
 		 997 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  28.03 
 
 		 997 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1000 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  24.93 
 
 		 1064 aa  55.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1039 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  23.88 
 
 		 960 aa  55.5  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  28.41 
 
 		 980 aa  54.7  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  27.38 
 
 		 1000 aa  54.7  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  23.27 
 
 		 1052 aa  53.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1052 aa  53.5  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  23.24 
 
 		 1059 aa  52.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  23.62 
 
 		 783 aa  51.6  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  25.74 
 
 		 984 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  30.57 
 
 		 1001 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  21.6 
 
 		 951 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  34.21 
 
 		 1016 aa  49.7  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.64 
 
 		 1042 aa  49.7  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  24.79 
 
 		 1062 aa  48.9  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  21.04 
 
 		 781 aa  48.5  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  25.32 
 
 		 1076 aa  48.5  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  22.82 
 
 		 1043 aa  47.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  27.43 
 
 		 379 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  28.99 
 
 		 304 aa  47  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  38.71 
 
 		 1019 aa  47  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  24.68 
 
 		 986 aa  46.6  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  26.94 
 
 		 991 aa  47  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  28.76 
 
 		 1077 aa  47  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  24.4 
 
 		 968 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.19 
 
 		 989 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  25 
 
 		 1047 aa  45.8  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  24.22 
 
 		 864 aa  45.8  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  24.74 
 
 		 1047 aa  45.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.83 
 
 		 1149 aa  44.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  34.62 
 
 		 846 aa  44.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  31.13 
 
 		 323 aa  44.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  30.82 
 
 		 297 aa  44.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.78 
 
 		 957 aa  44.3  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  31.52 
 
 		 284 aa  44.3  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>