44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0978 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  42.09 
 
 		 984 aa  709    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  42.33 
 
 		 1100 aa  707    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  38.85 
 
 		 997 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  100 
 
 		 1000 aa  2019    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  24.82 
 
 		 909 aa  189  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  21.34 
 
 		 911 aa  180  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  24.12 
 
 		 951 aa  157  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  24.05 
 
 		 919 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  26.27 
 
 		 968 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  26.02 
 
 		 960 aa  123  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  23.32 
 
 		 969 aa  105  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  23.32 
 
 		 969 aa  105  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1039 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  26.2 
 
 		 781 aa  89  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  23.61 
 
 		 780 aa  75.5  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  24.84 
 
 		 786 aa  72  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.18 
 
 		 803 aa  71.2  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  21.32 
 
 		 788 aa  67  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  22.19 
 
 		 794 aa  67  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  25.98 
 
 		 993 aa  67  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  21.32 
 
 		 788 aa  65.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  21.32 
 
 		 788 aa  65.1  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  24.21 
 
 		 781 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1016 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  21.1 
 
 		 994 aa  52  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1049 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  23.39 
 
 		 872 aa  50.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.68 
 
 		 1016 aa  50.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  24.73 
 
 		 783 aa  50.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  24.3 
 
 		 1047 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  25.23 
 
 		 1015 aa  48.1  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  23.99 
 
 		 1047 aa  47.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  24.93 
 
 		 865 aa  47.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  27.73 
 
 		 913 aa  47.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  23.1 
 
 		 862 aa  47.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  26.02 
 
 		 991 aa  46.6  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.84 
 
 		 1048 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  29.83 
 
 		 912 aa  47  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  24.51 
 
 		 922 aa  46.2  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1926  hypothetical protein  25.74 
 
 		 338 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00847839  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  22.44 
 
 		 991 aa  45.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  23.31 
 
 		 858 aa  45.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  24.12 
 
 		 999 aa  44.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>