50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1438 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  100 
 
 		 1029 aa  1835    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1356  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  58.89 
 
 		 935 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  92.44 
 
 		 1029 aa  1197    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.27 
 
 		 1049 aa  105  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.55 
 
 		 1113 aa  95.5  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  20.98 
 
 		 1124 aa  85.9  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  26.01 
 
 		 1140 aa  85.9  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  24.95 
 
 		 1172 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  23.4 
 
 		 1218 aa  79  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.54 
 
 		 1171 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.54 
 
 		 1171 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.54 
 
 		 1171 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.78 
 
 		 1146 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  21.1 
 
 		 1171 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  32.4 
 
 		 1045 aa  75.1  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.54 
 
 		 1171 aa  75.1  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  36.44 
 
 		 1043 aa  74.7  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  21.54 
 
 		 1171 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  21.59 
 
 		 1171 aa  73.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  21.54 
 
 		 1171 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  28.97 
 
 		 1151 aa  73.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.42 
 
 		 1155 aa  72.4  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.29 
 
 		 1171 aa  72.4  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  24.49 
 
 		 865 aa  72  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.94 
 
 		 994 aa  71.2  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  20.3 
 
 		 1171 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  20.41 
 
 		 1171 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 915 aa  64.3  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.39 
 
 		 1048 aa  61.6  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.11 
 
 		 1169 aa  60.1  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.96 
 
 		 968 aa  58.5  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  34.5 
 
 		 986 aa  58.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.02 
 
 		 957 aa  57.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  26.98 
 
 		 990 aa  54.7  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  29.61 
 
 		 976 aa  54.3  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  31.03 
 
 		 962 aa  53.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.87 
 
 		 836 aa  52.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  32.18 
 
 		 1001 aa  52.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.09 
 
 		 773 aa  51.6  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  29.03 
 
 		 997 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  27.44 
 
 		 1000 aa  49.3  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  30.36 
 
 		 284 aa  49.3  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  28.49 
 
 		 997 aa  48.5  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.55 
 
 		 1165 aa  48.5  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  29.81 
 
 		 267 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  32.14 
 
 		 864 aa  45.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.67 
 
 		 831 aa  45.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  27.97 
 
 		 883 aa  45.4  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.25 
 
 		 915 aa  45.1  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  41.67 
 
 		 1157 aa  45.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>