156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1499 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  100 
 
 
1049 aa  2080    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  30.3 
 
 
1140 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  26.11 
 
 
915 aa  207  9e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.12 
 
 
986 aa  104  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.91 
 
 
1099 aa  98.6  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  21.98 
 
 
1124 aa  97.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  22.69 
 
 
1106 aa  93.6  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.49 
 
 
908 aa  92  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.09 
 
 
1113 aa  91.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  31.87 
 
 
1029 aa  89  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  21.8 
 
 
1186 aa  86.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.65 
 
 
1043 aa  85.9  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0946  hypothetical protein  19.8 
 
 
1081 aa  85.1  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.975146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  33.2 
 
 
1029 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  21.52 
 
 
1157 aa  79  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  21.52 
 
 
1157 aa  79  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.67 
 
 
1048 aa  77  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1356  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  32.38 
 
 
935 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188722  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.29 
 
 
994 aa  72.8  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  21.78 
 
 
1149 aa  72  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.6 
 
 
1149 aa  71.2  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  20.74 
 
 
1077 aa  70.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  29.57 
 
 
1151 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  27.62 
 
 
976 aa  70.1  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  30.47 
 
 
1100 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  20.27 
 
 
1159 aa  69.7  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.67 
 
 
1165 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  29.76 
 
 
1001 aa  68.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.5 
 
 
1171 aa  68.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  22.93 
 
 
1171 aa  67.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.93 
 
 
1171 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  22.93 
 
 
1171 aa  67.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.93 
 
 
1171 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.93 
 
 
1171 aa  67.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  22.86 
 
 
1218 aa  66.6  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  29.88 
 
 
1079 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.65 
 
 
1171 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.1 
 
 
1146 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.79 
 
 
1171 aa  65.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  28.57 
 
 
962 aa  65.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.51 
 
 
1171 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  27.7 
 
 
1151 aa  65.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  22.36 
 
 
1171 aa  64.7  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.86 
 
 
957 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0518  hypothetical protein  20.74 
 
 
1077 aa  63.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.49 
 
 
1158 aa  62  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.65 
 
 
958 aa  62  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.68 
 
 
1149 aa  62  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  24.89 
 
 
914 aa  61.6  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  24.29 
 
 
1260 aa  61.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.29 
 
 
1260 aa  61.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  26.29 
 
 
947 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  22.96 
 
 
1171 aa  60.1  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  27.62 
 
 
951 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  28.35 
 
 
1015 aa  60.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.35 
 
 
1270 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  28.14 
 
 
1052 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.35 
 
 
1270 aa  59.7  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  25.6 
 
 
960 aa  59.3  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  26.07 
 
 
1049 aa  59.3  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.21 
 
 
836 aa  58.9  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  21.92 
 
 
1155 aa  58.9  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.95 
 
 
1042 aa  58.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  23.95 
 
 
911 aa  58.5  0.0000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  20.75 
 
 
1158 aa  58.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  26.8 
 
 
1054 aa  58.2  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.36 
 
 
1274 aa  58.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.12 
 
 
1226 aa  56.6  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  23.7 
 
 
951 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  25.88 
 
 
1059 aa  56.2  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.1 
 
 
1190 aa  56.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  25.2 
 
 
890 aa  56.2  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  22.32 
 
 
969 aa  55.8  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  22.32 
 
 
969 aa  55.8  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.25 
 
 
1270 aa  55.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  28.27 
 
 
1045 aa  55.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.2 
 
 
1166 aa  55.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08480  RecB family exonuclease  25.35 
 
 
889 aa  55.1  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.67 
 
 
1187 aa  55.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  24.65 
 
 
930 aa  54.7  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  31.98 
 
 
277 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.28 
 
 
1234 aa  54.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  31.98 
 
 
277 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  33.17 
 
 
984 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  31.98 
 
 
277 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  25.16 
 
 
1047 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.56 
 
 
1234 aa  53.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.58 
 
 
1164 aa  53.5  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  23.07 
 
 
1172 aa  53.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2419  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.36 
 
 
1269 aa  53.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  23.88 
 
 
1060 aa  52.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 
1060 aa  52.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  25.81 
 
 
1123 aa  52.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  24.53 
 
 
1047 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2546  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.12 
 
 
1130 aa  51.6  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.59 
 
 
957 aa  51.6  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0420  hypothetical protein  32.58 
 
 
966 aa  51.6  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2931  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.12 
 
 
1130 aa  51.6  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  28.31 
 
 
304 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.27 
 
 
968 aa  50.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>