38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1321 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  100 
 
 
915 aa  1876    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.17 
 
 
1049 aa  187  9e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  23.41 
 
 
1140 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.83 
 
 
994 aa  65.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.08 
 
 
986 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.33 
 
 
1029 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.19 
 
 
1048 aa  60.1  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.62 
 
 
1121 aa  52.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  25.36 
 
 
304 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  25.65 
 
 
986 aa  50.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  22.17 
 
 
990 aa  50.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.91 
 
 
968 aa  49.3  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  27.75 
 
 
959 aa  48.9  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.51 
 
 
989 aa  49.3  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08480  RecB family exonuclease  24.2 
 
 
889 aa  48.9  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  21.25 
 
 
951 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  22.86 
 
 
1045 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1356  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  43.4 
 
 
935 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188722  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  26.92 
 
 
999 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  25.56 
 
 
291 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.15 
 
 
1029 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  25.08 
 
 
984 aa  47  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0420  hypothetical protein  21.54 
 
 
966 aa  46.2  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  21.19 
 
 
1158 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.97 
 
 
1159 aa  45.8  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  24.05 
 
 
333 aa  46.2  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.61 
 
 
1158 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0086  hypothetical protein  23.05 
 
 
945 aa  46.2  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.02 
 
 
1043 aa  45.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  21.83 
 
 
1172 aa  45.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  25 
 
 
1171 aa  45.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  24.07 
 
 
1149 aa  44.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  24.83 
 
 
277 aa  44.3  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  27.37 
 
 
1018 aa  44.3  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  24.83 
 
 
277 aa  44.3  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.04 
 
 
957 aa  44.3  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  24.83 
 
 
277 aa  44.3  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  25 
 
 
1059 aa  44.3  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>