21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0550 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  100 
 
 		 1140 aa  2340    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.97 
 
 		 1049 aa  424  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  23.41 
 
 		 915 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  24.93 
 
 		 1029 aa  79.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.91 
 
 		 1113 aa  74.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.91 
 
 		 1029 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1356  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.88 
 
 		 935 aa  58.9  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.71 
 
 		 1048 aa  58.9  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.37 
 
 		 986 aa  53.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  27.16 
 
 		 1045 aa  53.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  21.82 
 
 		 976 aa  52.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  33.1 
 
 		 1016 aa  52.4  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  23.91 
 
 		 908 aa  52  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  22.85 
 
 		 993 aa  51.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.8 
 
 		 994 aa  47.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  28.41 
 
 		 1106 aa  47.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  26.14 
 
 		 1149 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.49 
 
 		 1043 aa  46.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  23.04 
 
 		 914 aa  45.8  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  23.39 
 
 		 990 aa  45.4  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  22.75 
 
 		 988 aa  45.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>