86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1682 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  100 
 
 		 1106 aa  2263    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  54.96 
 
 		 1077 aa  1232    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.98 
 
 		 1099 aa  568  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  23.05 
 
 		 1158 aa  192  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.46 
 
 		 1158 aa  191  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  23.22 
 
 		 1171 aa  188  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.71 
 
 		 1146 aa  188  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.1 
 
 		 1260 aa  185  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.38 
 
 		 1159 aa  184  9.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1032  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.01 
 
 		 1158 aa  184  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.30431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0308  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.16 
 
 		 1161 aa  182  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  22.77 
 
 		 1170 aa  179  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  22.24 
 
 		 1172 aa  173  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.67 
 
 		 1149 aa  164  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.33 
 
 		 1171 aa  147  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.04 
 
 		 1171 aa  145  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  21.71 
 
 		 1124 aa  144  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.73 
 
 		 1171 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  23.48 
 
 		 1171 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.69 
 
 		 1171 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  20.98 
 
 		 1171 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.73 
 
 		 1171 aa  141  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  23.05 
 
 		 1151 aa  140  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.42 
 
 		 1171 aa  140  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.58 
 
 		 1171 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  22.08 
 
 		 1165 aa  139  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  22.58 
 
 		 1171 aa  139  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  22.58 
 
 		 1171 aa  139  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  23.89 
 
 		 1186 aa  137  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  22.18 
 
 		 1149 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  23.25 
 
 		 1159 aa  117  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  22.49 
 
 		 1157 aa  113  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  22.49 
 
 		 1157 aa  113  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  19.69 
 
 		 1169 aa  101  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  20.96 
 
 		 1155 aa  101  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  20.63 
 
 		 1218 aa  97.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  19.8 
 
 		 1121 aa  97.8  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.35 
 
 		 1049 aa  85.1  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  31.07 
 
 		 991 aa  64.3  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  31.71 
 
 		 1000 aa  61.6  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  31.71 
 
 		 997 aa  58.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  28.4 
 
 		 1059 aa  57.4  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  31.1 
 
 		 997 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1016 aa  55.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  25.94 
 
 		 911 aa  55.5  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  28.57 
 
 		 1047 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  28.57 
 
 		 962 aa  52.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  28.57 
 
 		 976 aa  53.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  28.57 
 
 		 1047 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  22.67 
 
 		 779 aa  51.6  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  26.71 
 
 		 991 aa  51.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  28.31 
 
 		 322 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  26.09 
 
 		 1001 aa  50.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  28.64 
 
 		 1076 aa  50.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  29.3 
 
 		 333 aa  49.3  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  27.78 
 
 		 988 aa  49.3  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.14 
 
 		 1042 aa  49.3  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  25.99 
 
 		 1014 aa  48.9  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  30.36 
 
 		 379 aa  48.5  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  28.8 
 
 		 1045 aa  48.9  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  26.63 
 
 		 951 aa  48.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1048 aa  48.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  28.4 
 
 		 299 aa  47.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  24.84 
 
 		 273 aa  48.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1018 aa  47.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  23.38 
 
 		 993 aa  48.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  28.41 
 
 		 1140 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  38.1 
 
 		 379 aa  48.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  26.92 
 
 		 284 aa  47  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  38.1 
 
 		 379 aa  47.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  24.37 
 
 		 890 aa  47  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  28.74 
 
 		 947 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  24.88 
 
 		 1043 aa  46.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  28.57 
 
 		 913 aa  46.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  27.5 
 
 		 788 aa  46.2  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  28.57 
 
 		 297 aa  46.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  28.66 
 
 		 302 aa  46.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1049 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  27.04 
 
 		 323 aa  45.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  26.74 
 
 		 788 aa  45.1  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  32.5 
 
 		 855 aa  45.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.19 
 
 		 1019 aa  45.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  30.06 
 
 		 278 aa  44.7  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  28.48 
 
 		 781 aa  44.7  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  28.31 
 
 		 298 aa  44.7  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  28.42 
 
 		 1052 aa  44.7  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>