68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0985 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  32.6 
 
 
1171 aa  658    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  100 
 
 
1157 aa  2396    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  100 
 
 
1157 aa  2396    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  32.74 
 
 
1170 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  32.43 
 
 
1171 aa  654    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  32.27 
 
 
1171 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  32.6 
 
 
1171 aa  660    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  32.27 
 
 
1171 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  32.6 
 
 
1171 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  71.91 
 
 
1159 aa  1776    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  32.6 
 
 
1171 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  32.27 
 
 
1171 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  32.6 
 
 
1171 aa  660    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  32.43 
 
 
1171 aa  654    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  31.76 
 
 
1172 aa  637    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  32.88 
 
 
1171 aa  631  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.13 
 
 
1165 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.72 
 
 
1155 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.86 
 
 
1149 aa  505  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  28.44 
 
 
1151 aa  502  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  28.46 
 
 
1218 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.46 
 
 
1146 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  28.02 
 
 
1158 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  27.58 
 
 
1158 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  27.3 
 
 
1186 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  27.48 
 
 
1149 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  26.61 
 
 
1171 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  26.84 
 
 
1124 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.37 
 
 
1159 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.34 
 
 
1260 aa  284  7.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1032  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.53 
 
 
1158 aa  241  5e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.30431  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.94 
 
 
1121 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0308  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.02 
 
 
1161 aa  232  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.82 
 
 
1169 aa  215  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.88 
 
 
1099 aa  157  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  20.56 
 
 
1077 aa  116  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  22.49 
 
 
1106 aa  113  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  20.6 
 
 
1049 aa  66.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.55 
 
 
986 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  19.46 
 
 
1113 aa  62  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4199  ATP-dependent DNA helicase Rep  18.75 
 
 
673 aa  52  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4142  ATP-dependent DNA helicase Rep  18.75 
 
 
673 aa  51.6  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11002  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4225  ATP-dependent DNA helicase Rep  18.75 
 
 
673 aa  51.6  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3994  ATP-dependent DNA helicase Rep  18.75 
 
 
673 aa  51.6  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03656  DNA helicase and single-stranded DNA-dependent ATPase  18.75 
 
 
673 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0354982  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.04 
 
 
674 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.04 
 
 
707 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.04 
 
 
674 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.04 
 
 
674 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  18.75 
 
 
673 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03605  hypothetical protein  18.75 
 
 
673 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0230376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4288  ATP-dependent DNA helicase Rep  18.75 
 
 
673 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.04 
 
 
674 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.58 
 
 
674 aa  50.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  20.9 
 
 
666 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.88 
 
 
673 aa  47.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  21.94 
 
 
671 aa  47.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4143  ATP-dependent DNA helicase Rep  18.53 
 
 
673 aa  47.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.71 
 
 
665 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  20 
 
 
673 aa  46.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.16 
 
 
674 aa  46.2  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  20 
 
 
673 aa  46.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  20 
 
 
673 aa  46.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.21 
 
 
675 aa  46.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  21.15 
 
 
659 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.14 
 
 
665 aa  45.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  27.82 
 
 
969 aa  45.1  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  27.82 
 
 
969 aa  45.1  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>