53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0524 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  100 
 
 		 779 aa  1597    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  29.09 
 
 		 914 aa  95.1  5e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  26.7 
 
 		 911 aa  88.6  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  27.31 
 
 		 890 aa  88.2  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1018 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  24.8 
 
 		 1047 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  24.41 
 
 		 1047 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  25.68 
 
 		 1037 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  25.29 
 
 		 1040 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1049 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  29.69 
 
 		 1001 aa  80.1  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  26.6 
 
 		 1015 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  26.45 
 
 		 1049 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.57 
 
 		 1048 aa  77.8  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  24.24 
 
 		 1052 aa  77  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1048 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  24.7 
 
 		 1045 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1049 aa  75.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  26.47 
 
 		 988 aa  75.5  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  24.31 
 
 		 1054 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  28.21 
 
 		 1043 aa  73.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1042 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  25.38 
 
 		 977 aa  71.2  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1053 aa  71.2  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  26.18 
 
 		 1076 aa  69.3  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  25.13 
 
 		 1052 aa  68.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1052 aa  68.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.09 
 
 		 1042 aa  68.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  27.27 
 
 		 1059 aa  68.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  24.71 
 
 		 993 aa  68.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  26.4 
 
 		 1047 aa  66.6  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.65 
 
 		 958 aa  63.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  25 
 
 		 991 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  24.5 
 
 		 980 aa  63.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  26.42 
 
 		 1000 aa  62.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  26.74 
 
 		 997 aa  62  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  27.23 
 
 		 997 aa  60.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  24.59 
 
 		 991 aa  58.9  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  26.67 
 
 		 959 aa  58.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  30 
 
 		 986 aa  57.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  22.67 
 
 		 1106 aa  51.6  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  23.2 
 
 		 1014 aa  50.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  24.48 
 
 		 1064 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  29.17 
 
 		 780 aa  50.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  26.69 
 
 		 351 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  23.98 
 
 		 999 aa  48.5  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1016 aa  47.8  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  23.14 
 
 		 302 aa  47.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.37 
 
 		 836 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  19.17 
 
 		 1077 aa  47.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  23.08 
 
 		 1062 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.1 
 
 		 915 aa  46.2  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  22.95 
 
 		 1064 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>