39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0308 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  33.72 
 
 		 1159 aa  640    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0308  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  100 
 
 		 1161 aa  2357    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.43 
 
 		 1260 aa  332  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1032  ATP-dependent nuclease, subunit B  26.94 
 
 		 1158 aa  322  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.30431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.67 
 
 		 1171 aa  318  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.63 
 
 		 1171 aa  318  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.55 
 
 		 1171 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  24.63 
 
 		 1171 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  24.63 
 
 		 1171 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.91 
 
 		 1171 aa  312  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.55 
 
 		 1171 aa  312  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  24.22 
 
 		 1170 aa  313  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.22 
 
 		 1171 aa  312  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  24.28 
 
 		 1171 aa  311  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  24.46 
 
 		 1172 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.22 
 
 		 1171 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  22.69 
 
 		 1171 aa  278  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.47 
 
 		 1149 aa  270  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  23.8 
 
 		 1149 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.25 
 
 		 1155 aa  258  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  24.52 
 
 		 1158 aa  255  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  23.69 
 
 		 1218 aa  247  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  24.25 
 
 		 1158 aa  246  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.83 
 
 		 1146 aa  245  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  24.11 
 
 		 1186 aa  244  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  22.89 
 
 		 1165 aa  244  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  23.24 
 
 		 1151 aa  243  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  22.69 
 
 		 1159 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  23.02 
 
 		 1157 aa  232  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  23.02 
 
 		 1157 aa  232  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  22.82 
 
 		 1124 aa  211  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  22.34 
 
 		 1171 aa  210  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.03 
 
 		 1099 aa  209  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  23.91 
 
 		 1077 aa  187  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  24.16 
 
 		 1106 aa  182  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.37 
 
 		 1169 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.36 
 
 		 1121 aa  127  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.38 
 
 		 1048 aa  53.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.81 
 
 		 1113 aa  53.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>