47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1485 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  34.64 
 
 
1186 aa  708    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  36.01 
 
 
1146 aa  780    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  42.64 
 
 
1155 aa  940    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  31.76 
 
 
1157 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  31.76 
 
 
1157 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  49.27 
 
 
1170 aa  1164    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  48.55 
 
 
1171 aa  1146    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  35.78 
 
 
1149 aa  781    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  44.34 
 
 
1165 aa  978    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  48.97 
 
 
1171 aa  1176    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  48.97 
 
 
1171 aa  1175    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  48.8 
 
 
1171 aa  1176    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  48.89 
 
 
1171 aa  1180    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  48.8 
 
 
1171 aa  1172    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  36.73 
 
 
1218 aa  734    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  33.1 
 
 
1149 aa  697    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  70.88 
 
 
1171 aa  1797    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  100 
 
 
1172 aa  2405    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  35.89 
 
 
1124 aa  717    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  48.8 
 
 
1171 aa  1173    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  48.89 
 
 
1171 aa  1177    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  48.89 
 
 
1171 aa  1171    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  48.8 
 
 
1171 aa  1173    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  41.38 
 
 
1151 aa  830    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  32.71 
 
 
1158 aa  681    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  32.6 
 
 
1158 aa  682    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  31.82 
 
 
1159 aa  636    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  32.43 
 
 
1171 aa  618  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.24 
 
 
1260 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.05 
 
 
1121 aa  345  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  25.44 
 
 
1159 aa  338  5e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0308  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.54 
 
 
1161 aa  315  2.9999999999999996e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1032  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.97 
 
 
1158 aa  279  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.30431  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.14 
 
 
1169 aa  249  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.77 
 
 
1099 aa  209  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  22.41 
 
 
1106 aa  179  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  23.72 
 
 
1077 aa  140  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.04 
 
 
986 aa  79.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.21 
 
 
1113 aa  74.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  29.68 
 
 
1029 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.94 
 
 
994 aa  61.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.51 
 
 
1029 aa  58.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  23.17 
 
 
735 aa  48.5  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0946  hypothetical protein  21.03 
 
 
1081 aa  47  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.975146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1356  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.41 
 
 
935 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188722  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  21.83 
 
 
915 aa  45.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.32 
 
 
968 aa  44.7  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>