64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2194 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  48.98 
 
 		 883 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  72.93 
 
 		 856 aa  1178    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  62.26 
 
 		 846 aa  947    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  50.29 
 
 		 856 aa  697    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  100 
 
 		 855 aa  1696    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  50.4 
 
 		 856 aa  698    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  51.78 
 
 		 864 aa  732    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  48.19 
 
 		 940 aa  548  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  38.38 
 
 		 915 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  36.42 
 
 		 947 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  35.2 
 
 		 951 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  36.25 
 
 		 962 aa  264  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  34.01 
 
 		 976 aa  246  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  34.01 
 
 		 957 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  27.66 
 
 		 991 aa  178  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.77 
 
 		 836 aa  164  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  27.18 
 
 		 994 aa  154  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.93 
 
 		 958 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  27.45 
 
 		 980 aa  73.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  27.19 
 
 		 993 aa  63.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  29.09 
 
 		 1054 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  26.95 
 
 		 990 aa  58.2  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  26.64 
 
 		 865 aa  58.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 		 1016 aa  57.4  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.37 
 
 		 994 aa  57.4  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  25.08 
 
 		 1047 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  24.92 
 
 		 1047 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  22.12 
 
 		 803 aa  53.9  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  26.56 
 
 		 1037 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  25.96 
 
 		 1158 aa  53.5  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  25.89 
 
 		 1158 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  22.5 
 
 		 1077 aa  52  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1052 aa  52  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  30.1 
 
 		 1001 aa  51.2  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  42.19 
 
 		 379 aa  50.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.81 
 
 		 1169 aa  50.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1048 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  23.66 
 
 		 1052 aa  50.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  29.24 
 
 		 1059 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  29.96 
 
 		 299 aa  50.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  26.8 
 
 		 1045 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.3 
 
 		 968 aa  49.3  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  28.01 
 
 		 1000 aa  49.7  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  25.62 
 
 		 920 aa  49.3  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.41 
 
 		 1052 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  26.98 
 
 		 280 aa  48.5  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  30.22 
 
 		 277 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  30.22 
 
 		 277 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  30.22 
 
 		 277 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  39.06 
 
 		 379 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  25.88 
 
 		 912 aa  47.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  26.09 
 
 		 896 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  29.38 
 
 		 1076 aa  45.8  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  28.44 
 
 		 986 aa  46.2  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  25.46 
 
 		 911 aa  46.2  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  26.21 
 
 		 991 aa  45.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1039 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  32.5 
 
 		 1106 aa  45.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23 
 
 		 1019 aa  45.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 1094 aa  44.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  37.5 
 
 		 379 aa  45.1  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  25.1 
 
 		 781 aa  44.7  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.98 
 
 		 989 aa  44.3  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3583  hypothetical protein  19.19 
 
 		 853 aa  44.3  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0256387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>