77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0904 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  60.88 
 
 
312 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  59.04 
 
 
293 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  61.33 
 
 
306 aa  335  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  60.22 
 
 
287 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  55.51 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  56.68 
 
 
302 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  56.68 
 
 
302 aa  295  7e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  71.9 
 
 
284 aa  278  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  48.2 
 
 
286 aa  245  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  33.09 
 
 
295 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  30.55 
 
 
333 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  34.07 
 
 
294 aa  92  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  30.53 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  34.2 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  31.68 
 
 
299 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  31.48 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  30.27 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  31.44 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  31.01 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  32.25 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  32.25 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  32.25 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  25.7 
 
 
379 aa  82.4  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  32.32 
 
 
334 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  32.17 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  28.41 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.6 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  31.23 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  28.41 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  30.4 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  31 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  32.12 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  28.77 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  28.99 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  31.34 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  30.24 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  23.89 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  30.34 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  30.97 
 
 
284 aa  79  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  30.59 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  28.79 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  25.27 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  30.56 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  31.01 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  19.69 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  29.09 
 
 
387 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  28.79 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  28.79 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.72 
 
 
1019 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  28.41 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  31.23 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  22.26 
 
 
411 aa  67  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  25.93 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  27.56 
 
 
387 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  32.37 
 
 
1197 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  25.99 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  28.9 
 
 
1052 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 
1098 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 
1076 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  31.29 
 
 
984 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  26.22 
 
 
1055 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  23.57 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  25.66 
 
 
781 aa  46.6  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  26.59 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 
1062 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  23.72 
 
 
1134 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 
1038 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  25.38 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1358  DNA helicase II  23.98 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.248341  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  27.56 
 
 
865 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.05 
 
 
1016 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  28.02 
 
 
1051 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  28.02 
 
 
1051 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 
1074 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  28.02 
 
 
1051 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.49 
 
 
836 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0563603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>