71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3814 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  552  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  71.9 
 
 		 276 aa  278  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  59.41 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  56.39 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  56.25 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  60.19 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  53.39 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  51.16 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  52.36 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  51.42 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  34.34 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  28.22 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  25.4 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  29.96 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.52 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  30.57 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  30.72 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  29.7 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  30.37 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  31.12 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  31.38 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  26.82 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  30.05 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  32 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  27.27 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  23.91 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1019 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  31.14 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  30.82 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  26.92 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  33.72 
 
 		 322 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  30.29 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  28.85 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  32.82 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  29.31 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  34.81 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  28.9 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  36.3 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  28.99 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  31.79 
 
 		 1098 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  36.15 
 
 		 1038 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  31.79 
 
 		 334 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  30.36 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  54.17 
 
 		 1038 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  38.24 
 
 		 1051 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  27.56 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  38.24 
 
 		 1051 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  36.88 
 
 		 1051 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  20.63 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  56.25 
 
 		 1050 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  22.87 
 
 		 411 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  31.65 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  31.65 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  31.65 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.79 
 
 		 1066 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  31.9 
 
 		 1080 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  28.52 
 
 		 387 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  38.1 
 
 		 1106 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  25.36 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  30.12 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  50 
 
 		 1055 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  26.14 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  29.13 
 
 		 387 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  35.14 
 
 		 906 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.25 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 1197 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  33.1 
 
 		 1040 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  30.16 
 
 		 781 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.51 
 
 		 1051 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  46.55 
 
 		 1095 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1768  hypothetical protein  26.56 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>