33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2921 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2921  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3553  hypothetical protein  30.92 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  28.16 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  26.17 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 1019 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  24.8 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  27.13 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  27.13 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  23.48 
 
 		 946 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  23.48 
 
 		 946 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  26.25 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  26.74 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  26.74 
 
 		 387 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  26.17 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  26.74 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.68 
 
 		 1051 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2030  hypothetical protein  34.29 
 
 		 105 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  25.1 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2870  hypothetical protein  25.37 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.804578  normal  0.954362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 1040 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  25.66 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  26.98 
 
 		 1052 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2029  hypothetical protein  31.72 
 
 		 141 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  24.03 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.91 
 
 		 1066 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  25 
 
 		 1041 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1048 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  23.86 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  23.83 
 
 		 1059 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  23.64 
 
 		 1074 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  25.47 
 
 		 783 aa  43.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  25.39 
 
 		 1134 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>