144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2165 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2165  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 327 aa  670    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.770952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0751  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.05 
 
 		 392 aa  279  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0711  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.95 
 
 		 310 aa  275  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.067675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1196  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.96 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0452668 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0439  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  39.61 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.51 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.51 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28.51 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  32.88 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.92 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  28.04 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  21.78 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  24.28 
 
 		 545 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  35.9 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.3 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.91 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.34 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  26.8 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  22.91 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.2 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  22.94 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  23.79 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  23.9 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  23.85 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  25.48 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  23.76 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.83 
 
 		 559 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.23 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.71 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.56 
 
 		 731 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.27 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.52 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  20.5 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.28 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  23.61 
 
 		 731 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  32.14 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  27.74 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  27.45 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.7 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  25.57 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.77 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  24.28 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.57 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.5 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  22.74 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  22.19 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  22.84 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.76 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.03 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  24.03 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.05 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  26.95 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  23.94 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  29.06 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  24.52 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.24 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  30.22 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  29.05 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  21.38 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  27.95 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.26 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  32.85 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  21.3 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.78 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.71 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  24.31 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.97 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  38.14 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.43 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  25.19 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.4 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  31.97 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.31 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.64 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  22.43 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  23.77 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.29 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  27.31 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  28.15 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.21 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.32 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  34.52 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  22.82 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.73 
 
 		 544 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  25.09 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.4 
 
 		 402 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.65 
 
 		 398 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  29.69 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.91 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.48 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  28.15 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.74 
 
 		 580 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.73 
 
 		 594 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.66 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.27 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.87 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  28.21 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>