149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1196 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1196  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
303 aa  623  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0452668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0711  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.47 
 
 
310 aa  237  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.067675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0751  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 
392 aa  229  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2165  CRISPR-associated protein Cas1  36.96 
 
 
327 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.770952  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0439  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.78 
 
 
310 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  26.42 
 
 
727 aa  96.3  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  27.74 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.3 
 
 
731 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  24.34 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  23.15 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.15 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.42 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.41 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  22.89 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.87 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  25.61 
 
 
545 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.42 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  22.9 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  22.57 
 
 
594 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  28 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  25.23 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  21.62 
 
 
731 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  21.34 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.56 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28.87 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  19.84 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.85 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  29.27 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  22.06 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  22.97 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  26.32 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.76 
 
 
330 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.81 
 
 
570 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.53 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.65 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.56 
 
 
580 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.03 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.17 
 
 
559 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.72 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  22.35 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.76 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.93 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.86 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  24.67 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.57 
 
 
331 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.85 
 
 
326 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.6 
 
 
331 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  25.84 
 
 
330 aa  62.4  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.68 
 
 
550 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  23.21 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  26.32 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.14 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.95 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.85 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.49 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  19.16 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  24.85 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.94 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.93 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  23.68 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  23.19 
 
 
343 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.19 
 
 
341 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  27.97 
 
 
343 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  30.67 
 
 
343 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  22.26 
 
 
330 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.73 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  24.48 
 
 
326 aa  59.3  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.56 
 
 
322 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.43 
 
 
343 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  24.4 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  21.38 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.29 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  23.11 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  22.01 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.59 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  23.46 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.37 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  21.74 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  24.7 
 
 
342 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.17 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  23.24 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.98 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  25.98 
 
 
384 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.75 
 
 
344 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.17 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  24.53 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.8 
 
 
330 aa  56.6  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.75 
 
 
344 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  22.58 
 
 
326 aa  56.2  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  21.21 
 
 
598 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  22.46 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  21.95 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  19.79 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  21.69 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  22.61 
 
 
525 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.18 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.04 
 
 
343 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  22.8 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  19.84 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>