171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2841 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 525 aa  1051    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  33.46 
 
 		 545 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.18 
 
 		 544 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  35.65 
 
 		 598 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.18 
 
 		 550 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  32.67 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  40.17 
 
 		 346 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.74 
 
 		 570 aa  217  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  42.23 
 
 		 339 aa  216  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  41.35 
 
 		 339 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  38.18 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.82 
 
 		 344 aa  207  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  37.97 
 
 		 339 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.24 
 
 		 559 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  37.88 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  37.28 
 
 		 325 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  36.2 
 
 		 325 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.51 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.83 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.49 
 
 		 343 aa  195  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  33.53 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.49 
 
 		 347 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.86 
 
 		 344 aa  191  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  33.48 
 
 		 594 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.83 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  32.65 
 
 		 334 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  36.96 
 
 		 344 aa  190  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  40.29 
 
 		 344 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.61 
 
 		 343 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.9 
 
 		 350 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  33.82 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  35.67 
 
 		 344 aa  186  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.29 
 
 		 338 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  37.18 
 
 		 343 aa  183  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  36.34 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  37.28 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.12 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  35.71 
 
 		 346 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.01 
 
 		 343 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  32.27 
 
 		 333 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.99 
 
 		 339 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  31.98 
 
 		 343 aa  177  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.88 
 
 		 343 aa  177  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  41.64 
 
 		 323 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  36.98 
 
 		 326 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.69 
 
 		 350 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.55 
 
 		 342 aa  173  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.91 
 
 		 344 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  36 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.59 
 
 		 334 aa  172  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  34.69 
 
 		 343 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.72 
 
 		 341 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  30.52 
 
 		 343 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.95 
 
 		 343 aa  170  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.01 
 
 		 343 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  33.53 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  41.94 
 
 		 323 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.67 
 
 		 333 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  29.67 
 
 		 727 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  31.02 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  31.78 
 
 		 558 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  32.37 
 
 		 343 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  35.08 
 
 		 371 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.84 
 
 		 332 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  28.51 
 
 		 731 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.3 
 
 		 731 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  35.05 
 
 		 329 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  31.12 
 
 		 342 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.8 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.28 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.21 
 
 		 331 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.97 
 
 		 330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.8 
 
 		 342 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  28.12 
 
 		 333 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  29.97 
 
 		 331 aa  133  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  30.92 
 
 		 331 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  28.75 
 
 		 333 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  34.94 
 
 		 337 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  29.08 
 
 		 330 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  28.07 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.36 
 
 		 331 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  26.32 
 
 		 330 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  30.54 
 
 		 360 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  29.6 
 
 		 330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.25 
 
 		 326 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  29.1 
 
 		 331 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.53 
 
 		 320 aa  125  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  26.74 
 
 		 331 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.1 
 
 		 306 aa  124  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  36.73 
 
 		 207 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.71 
 
 		 333 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  26 
 
 		 322 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.29 
 
 		 337 aa  120  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  24.34 
 
 		 330 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.99 
 
 		 330 aa  119  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.09 
 
 		 337 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  28.34 
 
 		 330 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  32.18 
 
 		 691 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.75 
 
 		 331 aa  117  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  31.11 
 
 		 351 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>