171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2234 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
350 aa  718    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  41.31 
 
 
545 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.74 
 
 
544 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  37.64 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  37.64 
 
 
325 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  36.18 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  36.86 
 
 
598 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  35.14 
 
 
325 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.02 
 
 
339 aa  225  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  37.11 
 
 
333 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.05 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  37.92 
 
 
339 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  37.03 
 
 
550 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  37.14 
 
 
326 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.59 
 
 
570 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  35.53 
 
 
553 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  35.85 
 
 
594 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  36.9 
 
 
525 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.49 
 
 
559 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  33.82 
 
 
334 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  36.06 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  37.11 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  37.66 
 
 
580 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.47 
 
 
731 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.24 
 
 
333 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  34.75 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.58 
 
 
343 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  35.75 
 
 
731 aa  175  9e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.92 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.92 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.26 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  36.89 
 
 
323 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.05 
 
 
342 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.48 
 
 
343 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  31.82 
 
 
343 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  32.49 
 
 
346 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  32.11 
 
 
727 aa  169  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.68 
 
 
344 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.73 
 
 
330 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  31.36 
 
 
343 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.85 
 
 
330 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.8 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.05 
 
 
341 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  31.68 
 
 
344 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  34.09 
 
 
343 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.84 
 
 
332 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  29.94 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.79 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  29.91 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  31.44 
 
 
343 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  27.81 
 
 
330 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  28.33 
 
 
333 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  27.84 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.4 
 
 
343 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  30.11 
 
 
331 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.46 
 
 
344 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.91 
 
 
333 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  32.17 
 
 
330 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.75 
 
 
331 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  28.98 
 
 
333 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.28 
 
 
332 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  29.46 
 
 
331 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  29.38 
 
 
343 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  31.44 
 
 
344 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.83 
 
 
342 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.85 
 
 
330 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  31.39 
 
 
371 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  31.25 
 
 
346 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  27.22 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  32.39 
 
 
329 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  32.39 
 
 
342 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.55 
 
 
343 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  28.98 
 
 
343 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  36.02 
 
 
323 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.79 
 
 
321 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  30.26 
 
 
330 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  28.49 
 
 
344 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  28.93 
 
 
336 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  28.98 
 
 
346 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.51 
 
 
350 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  29.44 
 
 
344 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.24 
 
 
347 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.89 
 
 
331 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.25 
 
 
347 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.36 
 
 
344 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  30.14 
 
 
343 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  28.75 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.59 
 
 
338 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.86 
 
 
330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  27.57 
 
 
331 aa  146  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  26.13 
 
 
330 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.04 
 
 
327 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.07 
 
 
329 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  32.29 
 
 
337 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.28 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  26.29 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  41.67 
 
 
207 aa  135  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  33.03 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  29.77 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>