175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0772 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
342 aa  699    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  88.31 
 
 
326 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.38 
 
 
331 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  45.37 
 
 
325 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.68 
 
 
322 aa  293  4e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  36.76 
 
 
351 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.98 
 
 
334 aa  230  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  29.27 
 
 
337 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.49 
 
 
338 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.27 
 
 
337 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  28.1 
 
 
336 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.35 
 
 
337 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.26 
 
 
306 aa  133  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.94 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.33 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  27.12 
 
 
525 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  30.87 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  30.87 
 
 
325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  24.46 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  28.96 
 
 
545 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  29.1 
 
 
325 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  27.69 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.9 
 
 
339 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.81 
 
 
347 aa  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  29.54 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.72 
 
 
350 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  24.44 
 
 
598 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.33 
 
 
303 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.91 
 
 
343 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  27.15 
 
 
343 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.42 
 
 
339 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  24.61 
 
 
731 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.38 
 
 
731 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.83 
 
 
343 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  24.55 
 
 
727 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.06 
 
 
1031 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  22.7 
 
 
323 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  21.75 
 
 
691 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.49 
 
 
331 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  25.17 
 
 
342 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.11 
 
 
344 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  25.83 
 
 
326 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.29 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.63 
 
 
401 aa  99  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.16 
 
 
342 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  24.36 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  26.87 
 
 
334 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.76 
 
 
302 aa  99  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  25.84 
 
 
343 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  23.23 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.56 
 
 
344 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.55 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.49 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  25.58 
 
 
343 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  24.25 
 
 
346 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.85 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  25.08 
 
 
343 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.65 
 
 
343 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.4 
 
 
580 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.44 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.87 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.5 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.32 
 
 
550 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.15 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  24.75 
 
 
558 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  22.45 
 
 
339 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  23.62 
 
 
343 aa  93.6  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.91 
 
 
330 aa  94  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.23 
 
 
344 aa  94  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  25.17 
 
 
329 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.12 
 
 
290 aa  92.8  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  25.16 
 
 
343 aa  92.4  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  23.78 
 
 
553 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  25.68 
 
 
343 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.43 
 
 
320 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  21.17 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.99 
 
 
570 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.74 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.83 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  25.08 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  23.45 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.4 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.18 
 
 
294 aa  89.4  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  21.77 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  25 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  21.91 
 
 
346 aa  87  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  22.3 
 
 
594 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  23.75 
 
 
344 aa  86.3  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.1 
 
 
559 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.99 
 
 
342 aa  85.9  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.67 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.59 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.78 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  23.49 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.92 
 
 
544 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  23.26 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  22.94 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.56 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  20.85 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>