157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4330 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 343 aa  706    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  58.89 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  58.48 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  55.26 
 
 		 343 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  57.02 
 
 		 343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  52.92 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.77 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  53.94 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.29 
 
 		 344 aa  358  8e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  49.27 
 
 		 343 aa  355  5e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  50.29 
 
 		 343 aa  354  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.44 
 
 		 343 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  53.74 
 
 		 344 aa  349  5e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.03 
 
 		 344 aa  348  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  50.86 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.83 
 
 		 343 aa  345  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  49.71 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  48.84 
 
 		 346 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  50.87 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.8 
 
 		 338 aa  328  9e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  48.55 
 
 		 344 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.51 
 
 		 341 aa  307  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.47 
 
 		 343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.31 
 
 		 342 aa  299  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  44.81 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.27 
 
 		 343 aa  297  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.57 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  44.48 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  40.76 
 
 		 344 aa  279  6e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.47 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  38.76 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  36.98 
 
 		 545 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.55 
 
 		 344 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  36.34 
 
 		 598 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.44 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  34.93 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.93 
 
 		 550 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.23 
 
 		 559 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  37.13 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.23 
 
 		 339 aa  185  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.94 
 
 		 570 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  35.28 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.13 
 
 		 580 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.86 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.31 
 
 		 544 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34.94 
 
 		 553 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.66 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  32.43 
 
 		 594 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.34 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.48 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  32.95 
 
 		 525 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  31.34 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  29.64 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.87 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  31.04 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  31.94 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  30.95 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.68 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  29.68 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.47 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  28.91 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  31.31 
 
 		 727 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  26.62 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.41 
 
 		 731 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  28.91 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  31.49 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  32.67 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  27.51 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.41 
 
 		 330 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.86 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.41 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  27.81 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.43 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.74 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.73 
 
 		 558 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  26.74 
 
 		 731 aa  132  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  26.8 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  27.62 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.68 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  32.58 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.28 
 
 		 327 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  30.51 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.27 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  26.92 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.92 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.36 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.37 
 
 		 337 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.09 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.07 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.74 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.51 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  30.27 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  31.3 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  28.16 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  30.2 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  27.09 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  28.74 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  27.43 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.45 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.71 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>