161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2483 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
339 aa  703    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  64.31 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  61.47 
 
 
339 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  37.65 
 
 
545 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.88 
 
 
570 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.63 
 
 
550 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  36.5 
 
 
598 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  35.8 
 
 
334 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  39.33 
 
 
333 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  36.23 
 
 
727 aa  206  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.71 
 
 
731 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  37.73 
 
 
594 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.02 
 
 
350 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  37.03 
 
 
731 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.2 
 
 
544 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.95 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34.69 
 
 
553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  37.39 
 
 
339 aa  198  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  35.57 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.56 
 
 
338 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  35.28 
 
 
325 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.74 
 
 
341 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  36.01 
 
 
346 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.85 
 
 
333 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.44 
 
 
344 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.82 
 
 
559 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.31 
 
 
342 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  35.86 
 
 
336 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  35.76 
 
 
339 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  34.41 
 
 
343 aa  186  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.23 
 
 
343 aa  185  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  38.03 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  34.91 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  30.12 
 
 
336 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.73 
 
 
344 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  32.07 
 
 
325 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  32.75 
 
 
325 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.82 
 
 
343 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.63 
 
 
343 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.03 
 
 
343 aa  175  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  32.63 
 
 
343 aa  173  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  32.22 
 
 
331 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  34.58 
 
 
344 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  32.73 
 
 
343 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  32.84 
 
 
346 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.29 
 
 
344 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  33.91 
 
 
326 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.63 
 
 
343 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  33.92 
 
 
329 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  33.03 
 
 
343 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  33.44 
 
 
346 aa  169  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  34.99 
 
 
525 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  31.83 
 
 
344 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.88 
 
 
580 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  33.23 
 
 
343 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.73 
 
 
332 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.2 
 
 
347 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.64 
 
 
343 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  30.03 
 
 
343 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.76 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  32.43 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.43 
 
 
332 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  29.09 
 
 
338 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  33.74 
 
 
323 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  34.62 
 
 
344 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.26 
 
 
344 aa  155  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  31.14 
 
 
371 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.93 
 
 
342 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.14 
 
 
347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  33.23 
 
 
323 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  30.36 
 
 
558 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  29.34 
 
 
330 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  28.34 
 
 
330 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.73 
 
 
330 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  33.56 
 
 
691 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.81 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 
331 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  26.47 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  28.78 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.58 
 
 
306 aa  129  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  26.1 
 
 
333 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  26.39 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  30.55 
 
 
330 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  26.25 
 
 
330 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  27.64 
 
 
336 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  39.71 
 
 
207 aa  122  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  26.61 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.06 
 
 
331 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.32 
 
 
331 aa  119  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.05 
 
 
330 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.62 
 
 
333 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.78 
 
 
329 aa  116  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.46 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  26.86 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  31.01 
 
 
337 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.27 
 
 
320 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.16 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  24.05 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>