156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1877 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
333 aa  671    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.26 
 
 
330 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  51.51 
 
 
330 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  51.2 
 
 
333 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  48.8 
 
 
331 aa  350  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  52.41 
 
 
330 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.16 
 
 
319 aa  342  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.55 
 
 
331 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.9 
 
 
330 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.18 
 
 
330 aa  339  4e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  48.8 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  49.7 
 
 
331 aa  334  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.95 
 
 
330 aa  332  6e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.87 
 
 
331 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  49.7 
 
 
331 aa  331  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.91 
 
 
331 aa  330  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  44.88 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.8 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  47.72 
 
 
326 aa  309  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  48.05 
 
 
330 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.44 
 
 
321 aa  291  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.54 
 
 
327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  46.85 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.88 
 
 
329 aa  279  5e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  43.33 
 
 
330 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  43.82 
 
 
326 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  38.78 
 
 
360 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.62 
 
 
338 aa  265  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  39.95 
 
 
384 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  41.72 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.51 
 
 
328 aa  238  8e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  45.59 
 
 
259 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  36.97 
 
 
330 aa  230  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  36.34 
 
 
321 aa  229  6e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  35.26 
 
 
330 aa  226  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  38.07 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  36.97 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  34.04 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  37.08 
 
 
333 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  32.14 
 
 
332 aa  181  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  31.66 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.88 
 
 
326 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  27.74 
 
 
326 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  28.66 
 
 
545 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  28.19 
 
 
325 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.91 
 
 
350 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 
598 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.06 
 
 
550 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  25.96 
 
 
326 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 
553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.86 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.17 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.27 
 
 
544 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.41 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  26.49 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  26.63 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.99 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  26.49 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.61 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.1 
 
 
344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.96 
 
 
570 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  25.52 
 
 
339 aa  125  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.01 
 
 
343 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.75 
 
 
558 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  25.42 
 
 
329 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.05 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  22.19 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.8 
 
 
333 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.2 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  22.78 
 
 
525 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.53 
 
 
338 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  23.41 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  21.86 
 
 
594 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 
331 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  24.13 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.47 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  22.92 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  25.74 
 
 
333 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.19 
 
 
344 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  23.53 
 
 
343 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  23.53 
 
 
343 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.79 
 
 
342 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  25.98 
 
 
344 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.26 
 
 
339 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  23.31 
 
 
343 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  21.32 
 
 
559 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  22.99 
 
 
343 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  20.41 
 
 
346 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  21.97 
 
 
346 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  24.54 
 
 
342 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.35 
 
 
343 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  22.45 
 
 
336 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  21.83 
 
 
343 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.66 
 
 
344 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.96 
 
 
343 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  27.57 
 
 
336 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  19.88 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  21.5 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.87 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  23.4 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>