158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1007 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 343 aa  705    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  57.73 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  55.39 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  54.23 
 
 		 343 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  52.77 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  54.07 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.77 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  51.6 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.19 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  54.2 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  52.19 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  55.1 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.64 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  50.72 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  52.74 
 
 		 346 aa  362  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  50.73 
 
 		 343 aa  349  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  52.33 
 
 		 344 aa  345  6e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  50.43 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  50 
 
 		 344 aa  338  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.81 
 
 		 341 aa  318  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.61 
 
 		 343 aa  302  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.14 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.19 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.9 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  43.66 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  40.41 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  44.25 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.52 
 
 		 343 aa  272  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  44.61 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.19 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  37.24 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.05 
 
 		 339 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  36.31 
 
 		 598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  35.31 
 
 		 545 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  35.09 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.63 
 
 		 550 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.38 
 
 		 344 aa  196  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  36.47 
 
 		 559 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  34.99 
 
 		 326 aa  185  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.64 
 
 		 339 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  35.71 
 
 		 553 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.4 
 
 		 570 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.47 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.63 
 
 		 580 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.09 
 
 		 544 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  34.01 
 
 		 525 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.43 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  33.53 
 
 		 594 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  31.67 
 
 		 325 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  32.45 
 
 		 325 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  32.15 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  32.75 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.97 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  30.27 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.55 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.62 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.7 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  29.31 
 
 		 731 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.95 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.87 
 
 		 731 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  29.15 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  30.43 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  30.21 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.47 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  27.78 
 
 		 727 aa  135  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.62 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  27.99 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.12 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  32 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  28.53 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  28.78 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.99 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  26.62 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  27.48 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  30.42 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.12 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.27 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  28.38 
 
 		 558 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  28.8 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  26.14 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  26.14 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  29.34 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  26.71 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.76 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.97 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  28.15 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  29.29 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.87 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.71 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.95 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.51 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.93 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  28.38 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.64 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  27.94 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  25.4 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  27.08 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.84 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.56 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>