158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0942 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 330 aa  667    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  64.55 
 
 		 330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  58.08 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.79 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.48 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  59.64 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  55.26 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  55.86 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.78 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  53.78 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  55.59 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  56.06 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.17 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  50 
 
 		 330 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  53.03 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.47 
 
 		 331 aa  364  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.18 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.44 
 
 		 319 aa  338  9e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  51.36 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.5 
 
 		 333 aa  317  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.5 
 
 		 321 aa  308  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  46.22 
 
 		 326 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  46.22 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.64 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.82 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  46.85 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  39.94 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  39.79 
 
 		 384 aa  276  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.95 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  37.46 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  49.62 
 
 		 259 aa  255  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  36.56 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.51 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  35.05 
 
 		 331 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  42.01 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  41.28 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  38.53 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  39.38 
 
 		 333 aa  235  9e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  38.15 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  32.94 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  32.26 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.27 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  30.59 
 
 		 545 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  28.96 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  27.07 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  27.27 
 
 		 325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.01 
 
 		 339 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.66 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28.66 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.36 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.86 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  27.57 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.17 
 
 		 338 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  26.59 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  27.36 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.3 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  26.3 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25 
 
 		 550 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  26.58 
 
 		 594 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.27 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.48 
 
 		 344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.87 
 
 		 544 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  24.5 
 
 		 598 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  26.51 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  24.32 
 
 		 553 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  27.12 
 
 		 339 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  26.02 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.33 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.62 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  25.66 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.78 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.67 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.88 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  23.24 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  25.07 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  26.48 
 
 		 343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  25.84 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  27.48 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.66 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  26.35 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  23.99 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  24.83 
 
 		 338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.42 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.77 
 
 		 580 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.36 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  25.44 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  25.54 
 
 		 558 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.48 
 
 		 559 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  25.56 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  24.27 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.05 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.4 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.01 
 
 		 731 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  23.89 
 
 		 343 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  24.1 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  24.13 
 
 		 346 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.23 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.61 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>