146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0303 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  77.99 
 
 		 333 aa  428  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.74 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  49.81 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  47.57 
 
 		 384 aa  259  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  50.38 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.03 
 
 		 330 aa  255  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.62 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  48.08 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  49.23 
 
 		 333 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  47.29 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  47.67 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  51.15 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  47.88 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  49.24 
 
 		 360 aa  247  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  46.51 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  49.22 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.08 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.08 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.23 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.06 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.59 
 
 		 333 aa  237  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  45 
 
 		 330 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  46.36 
 
 		 331 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.77 
 
 		 327 aa  234  8e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.21 
 
 		 331 aa  234  9e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  46.72 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.62 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  41.63 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  41.7 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  40.08 
 
 		 330 aa  210  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  38.13 
 
 		 331 aa  203  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.08 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  41.31 
 
 		 333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  39.38 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.23 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  38.61 
 
 		 334 aa  185  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.6 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  38.76 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.77 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  35.94 
 
 		 332 aa  126  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  30.42 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  32.98 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.57 
 
 		 339 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  28.11 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.21 
 
 		 339 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  28.11 
 
 		 545 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  28.12 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.03 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  26.25 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.03 
 
 		 544 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  27.31 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  27.31 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  24.37 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  26.86 
 
 		 598 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  27.56 
 
 		 339 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.77 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  27.06 
 
 		 346 aa  95.5  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.35 
 
 		 341 aa  95.5  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.63 
 
 		 344 aa  95.5  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.41 
 
 		 330 aa  95.5  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  26.02 
 
 		 334 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  26.74 
 
 		 346 aa  92.8  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.39 
 
 		 333 aa  92.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.69 
 
 		 344 aa  92  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.48 
 
 		 347 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  28.81 
 
 		 346 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.22 
 
 		 344 aa  90.1  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.62 
 
 		 343 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  26.42 
 
 		 336 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.78 
 
 		 342 aa  89.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.67 
 
 		 558 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.4 
 
 		 338 aa  88.6  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 343 aa  88.6  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.1 
 
 		 550 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  24.72 
 
 		 344 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  24.71 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  27.27 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  27.51 
 
 		 525 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  25.48 
 
 		 343 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.9 
 
 		 343 aa  85.9  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  22.93 
 
 		 343 aa  85.5  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  26.27 
 
 		 336 aa  85.5  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  24.46 
 
 		 594 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.05 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.03 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  25.89 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  26.36 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.91 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  27.62 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.44 
 
 		 570 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  24.9 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  21.76 
 
 		 559 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  22.99 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.23 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.69 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.71 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  25.37 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  22.61 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>