160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3327 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 331 aa  684    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  53.82 
 
 		 330 aa  394  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  55.35 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  37.61 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.18 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  36.62 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  37.35 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.5 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  36.56 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  36.06 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  38.23 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.14 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  40.06 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  36.7 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  38.62 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  35.08 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.05 
 
 		 330 aa  247  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.14 
 
 		 333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.86 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  36.83 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  38.37 
 
 		 384 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.94 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.15 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  33.94 
 
 		 330 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.17 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.13 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  33.94 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.04 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.15 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.75 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  35.28 
 
 		 330 aa  208  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.44 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  38.13 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  34.04 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  34.87 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  34.66 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.89 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  32.09 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.17 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  30.58 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  29.48 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  28.91 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  32 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  29.47 
 
 		 545 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.27 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  31.48 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.26 
 
 		 338 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  30.14 
 
 		 598 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  25.62 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.14 
 
 		 544 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  29.63 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  25.08 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  25.08 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  28.66 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  25.08 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  30.7 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  29.81 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.22 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  28.53 
 
 		 594 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.88 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  29.41 
 
 		 346 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  27.33 
 
 		 553 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.18 
 
 		 550 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.94 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  26.97 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.88 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.36 
 
 		 580 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.3 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.92 
 
 		 570 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  29.1 
 
 		 525 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.13 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  30.69 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.52 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.27 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  26.44 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  25.16 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.2 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  25.86 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.73 
 
 		 559 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  27.1 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  24.13 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.44 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.47 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  33.53 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  21.74 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.36 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.62 
 
 		 343 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  26.38 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.44 
 
 		 339 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.33 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  23.49 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  26.89 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  26.13 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  25.08 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.01 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0915  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.8 
 
 		 186 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00714947  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  30.2 
 
 		 343 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  23.89 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.49 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>