158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02696 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  100 
 
 		 344 aa  694    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  73.99 
 
 		 346 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  59.54 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  60.23 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  61.67 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  53.78 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.33 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  52.03 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  52.33 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  53.78 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.2 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  55.23 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.17 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.31 
 
 		 344 aa  348  8e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.87 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  48.55 
 
 		 343 aa  335  7e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  50.87 
 
 		 343 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.33 
 
 		 343 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  49.13 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  49.42 
 
 		 343 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.67 
 
 		 338 aa  317  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.12 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.28 
 
 		 343 aa  308  8e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  45.29 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.86 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  48.82 
 
 		 339 aa  301  9e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.47 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  48.07 
 
 		 339 aa  298  7e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  47.97 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.35 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  44.28 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  37.72 
 
 		 598 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.35 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  34.72 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  32.84 
 
 		 545 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.53 
 
 		 550 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.31 
 
 		 559 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.55 
 
 		 339 aa  188  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.91 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34.74 
 
 		 553 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  36.5 
 
 		 594 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.82 
 
 		 580 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.43 
 
 		 570 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  34.03 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  34.78 
 
 		 326 aa  179  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  36.96 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  33.73 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.43 
 
 		 544 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  34.02 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.33 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  32.06 
 
 		 731 aa  169  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.86 
 
 		 731 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  32.12 
 
 		 727 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  32.74 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.31 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.07 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  33.72 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.08 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.36 
 
 		 347 aa  152  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  31.96 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  30.93 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  29.62 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  32.36 
 
 		 558 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  29.09 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  32.68 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  29.61 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  29.63 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  28.92 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.09 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.78 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.44 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.38 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  27 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  28.66 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  26.57 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  27.43 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  30.03 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.53 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.28 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  27.6 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.29 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  32.9 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.61 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  29.38 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  30.38 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  24.05 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.82 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  30.85 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  32.83 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  31.56 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  27.61 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  28.18 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.38 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.87 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.07 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.58 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.29 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  30.1 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>