153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0445 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 384 aa  798    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  45.72 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.41 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  44.03 
 
 		 330 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  43.88 
 
 		 330 aa  331  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  44.21 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.71 
 
 		 333 aa  320  3e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.5 
 
 		 331 aa  312  7.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  42.71 
 
 		 330 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.71 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.67 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.44 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  41.11 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  42.44 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  41.64 
 
 		 326 aa  298  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.97 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.79 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  41.38 
 
 		 331 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  40.96 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  40.85 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  39.26 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.95 
 
 		 333 aa  280  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  41.91 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  41.01 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.67 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.2 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.57 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.4 
 
 		 331 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  47.76 
 
 		 259 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.81 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  38.37 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  39.37 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  38.56 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.92 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  41.23 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  40.66 
 
 		 322 aa  240  4e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  41.32 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  40.86 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  37.85 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.87 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  34.07 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  34.97 
 
 		 332 aa  187  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  32.59 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  30.19 
 
 		 598 aa  139  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  29.47 
 
 		 545 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  28.53 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.27 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.21 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.05 
 
 		 559 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.76 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.51 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  28.17 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.99 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  25.22 
 
 		 325 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  26.08 
 
 		 553 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  28.89 
 
 		 346 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.43 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  29.87 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.32 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.28 
 
 		 544 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  25.36 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.53 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  27.15 
 
 		 594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.79 
 
 		 570 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  27.06 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.21 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  24.85 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.12 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  27.42 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.87 
 
 		 580 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.62 
 
 		 550 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.6 
 
 		 341 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.98 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.16 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.84 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.58 
 
 		 558 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.65 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  25.45 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.2 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  26.09 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.4 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  25.9 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  25.73 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  28.57 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.94 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  25.95 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  25.08 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  26.07 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  25.32 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.27 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  27.27 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  27.42 
 
 		 343 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.83 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.83 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  28.3 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  24.75 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  26.06 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  25.9 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  25.89 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>