163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2838 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
330 aa  685    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  72.42 
 
 
330 aa  528  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  55.35 
 
 
331 aa  397  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  44.11 
 
 
330 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  41.82 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.34 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  40.91 
 
 
330 aa  293  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.53 
 
 
338 aa  292  4e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.79 
 
 
327 aa  288  9e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.99 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.27 
 
 
330 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  38.67 
 
 
326 aa  278  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.92 
 
 
333 aa  276  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  38.67 
 
 
330 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  39.88 
 
 
331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  41.87 
 
 
331 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  41.49 
 
 
333 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  38.55 
 
 
331 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.46 
 
 
330 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  40.18 
 
 
333 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  36.97 
 
 
326 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.16 
 
 
330 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.58 
 
 
330 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  38.61 
 
 
360 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.86 
 
 
331 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  37.46 
 
 
330 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.46 
 
 
331 aa  256  5e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  39.27 
 
 
330 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  38.56 
 
 
384 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.97 
 
 
333 aa  230  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  41.63 
 
 
259 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  35.67 
 
 
333 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  35.37 
 
 
335 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.45 
 
 
319 aa  216  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  34.45 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  33.75 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  34.76 
 
 
321 aa  211  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.03 
 
 
329 aa  205  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.18 
 
 
328 aa  199  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.45 
 
 
326 aa  198  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  33.74 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  30.94 
 
 
545 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  29.22 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  30.03 
 
 
332 aa  153  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.82 
 
 
544 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.06 
 
 
325 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28.06 
 
 
325 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  27.03 
 
 
325 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  32.08 
 
 
339 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.83 
 
 
325 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  31.66 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  30.93 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.52 
 
 
341 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.23 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.53 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.34 
 
 
339 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  30.79 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.84 
 
 
330 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  28.96 
 
 
553 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.67 
 
 
598 aa  135  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  30.55 
 
 
346 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.46 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  30.57 
 
 
343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.38 
 
 
343 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.13 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.82 
 
 
342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.58 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  30.43 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.71 
 
 
558 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  28.18 
 
 
343 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  28.75 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  28.12 
 
 
344 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.97 
 
 
343 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.69 
 
 
594 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.65 
 
 
570 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  29.6 
 
 
525 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  24.53 
 
 
334 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.07 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  30.65 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  26.93 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  25.63 
 
 
338 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  26.13 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.73 
 
 
344 aa  116  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.47 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  26.22 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  27.94 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.69 
 
 
550 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.87 
 
 
343 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  27.91 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0915  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.46 
 
 
186 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00714947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.73 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.71 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.42 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  29.23 
 
 
344 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  27.83 
 
 
339 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  26.26 
 
 
343 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.84 
 
 
332 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  26.61 
 
 
343 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.16 
 
 
580 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>