148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1803 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  689    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  83.43 
 
 		 335 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  61.89 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  56.21 
 
 		 322 aa  395  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  44.44 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.32 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.55 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  40.31 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  40.91 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.45 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  40.91 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.49 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.23 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  40.3 
 
 		 330 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  38.53 
 
 		 331 aa  241  9e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  39.7 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.54 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  40.62 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  41.44 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.38 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  39.39 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  40 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  37.54 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.89 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.94 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  41.23 
 
 		 384 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.33 
 
 		 331 aa  225  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  35.67 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.41 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  38.53 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  38.97 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.08 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  38.15 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  32.62 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.49 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  41.31 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  34.04 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.22 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.86 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.33 
 
 		 326 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  28.16 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  29.03 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  29.03 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  31.55 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  31.47 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  25.55 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  25.95 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  28.44 
 
 		 545 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.21 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.35 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  27.86 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  24.51 
 
 		 598 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  25.5 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.72 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.68 
 
 		 570 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  27.4 
 
 		 594 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  24.7 
 
 		 553 aa  99.4  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.24 
 
 		 350 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.3 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  29.09 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  26.78 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.09 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  25.99 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.89 
 
 		 544 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  28.48 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.17 
 
 		 550 aa  93.2  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.31 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.65 
 
 		 333 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  23.47 
 
 		 334 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.81 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.66 
 
 		 559 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.71 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  24.91 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  25.4 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  26.35 
 
 		 344 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.46 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.31 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.75 
 
 		 344 aa  89  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  25.4 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  24.16 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.02 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  24.92 
 
 		 339 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  24.39 
 
 		 331 aa  85.9  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.73 
 
 		 580 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  26.52 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  24.01 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  24.32 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  22.36 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.85 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  22.04 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  22.54 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  22.9 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.14 
 
 		 731 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  25.48 
 
 		 727 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  23.65 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.1 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.7 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  23.01 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  23.89 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 731 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>