155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1811 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 331 aa  675    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  70.39 
 
 		 331 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  57.7 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  57.53 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  54.49 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.87 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.17 
 
 		 330 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.57 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  53.89 
 
 		 333 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  54.68 
 
 		 330 aa  374  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  51.06 
 
 		 330 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  53.78 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.6 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  51.05 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  49.4 
 
 		 330 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.55 
 
 		 333 aa  342  5.999999999999999e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.19 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  46.08 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  45.18 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.03 
 
 		 319 aa  305  7e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.81 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  44.88 
 
 		 330 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  44.71 
 
 		 326 aa  292  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.82 
 
 		 338 aa  292  7e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.51 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.52 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  40.28 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.46 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  40.44 
 
 		 322 aa  258  7e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  38.86 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  39.16 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  41.46 
 
 		 384 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  38.23 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  37.92 
 
 		 334 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  38.23 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.48 
 
 		 328 aa  237  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  44.62 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  38.11 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  35.17 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  35.24 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  32.65 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  33.53 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.73 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 545 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.25 
 
 		 325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  33 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  29.62 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  27.62 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  29.62 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.43 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  31.18 
 
 		 339 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  32.35 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.69 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.48 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.45 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.56 
 
 		 544 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.65 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.02 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  29.68 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  26.25 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.11 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  27.62 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  26.67 
 
 		 553 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.61 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.94 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  25.63 
 
 		 598 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.32 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.65 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  26.47 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.1 
 
 		 330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  30.66 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.43 
 
 		 594 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  29.54 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  26.69 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.82 
 
 		 550 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.45 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  30.38 
 
 		 336 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  26.45 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  28.75 
 
 		 525 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  27.71 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  28.76 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  27.19 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  25.22 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.64 
 
 		 559 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.36 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.71 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  25.8 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.58 
 
 		 570 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  27.68 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.69 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  28.86 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.22 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.47 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  27.33 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  27.09 
 
 		 727 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.57 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  28.24 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.97 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  26.44 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>