160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0999 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 326 aa  658    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  76.99 
 
 		 326 aa  498  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  31.52 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.91 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  29.75 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  34.45 
 
 		 330 aa  198  9e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  31.4 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.88 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  33.13 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  32.62 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  30.72 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  30.98 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.73 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  31.21 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  34.17 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  31.23 
 
 		 333 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.48 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.25 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  30.33 
 
 		 333 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  30 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.33 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  29.39 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  33.87 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.3 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.27 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  31.33 
 
 		 333 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.88 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  30.64 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.48 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.18 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  31.25 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  29.43 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  28.84 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.5 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  31.06 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  28.14 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.16 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.69 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  30 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  30.77 
 
 		 259 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  27.03 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  25.6 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.62 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  27.04 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  26.73 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  26.01 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  26.81 
 
 		 545 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.65 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.47 
 
 		 544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  29.23 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  29.69 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  25.89 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  25.73 
 
 		 598 aa  105  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.04 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  25.47 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.55 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.21 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.78 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.55 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.91 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  24.92 
 
 		 553 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  28.78 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  27.27 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.79 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  26.93 
 
 		 691 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  27.79 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  27.14 
 
 		 346 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.92 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.85 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  28.33 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  28.91 
 
 		 558 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  25.17 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.36 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  27.2 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  24.84 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  24.84 
 
 		 343 aa  86.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  29.57 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  25.69 
 
 		 346 aa  85.9  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  28.39 
 
 		 594 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  25.6 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.63 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.5 
 
 		 570 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.12 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  27.43 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.39 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.75 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.05 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  27.82 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.73 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  31.16 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  26.98 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  21.39 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.66 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  23.6 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.94 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  19.37 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.06 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  23.67 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  23.65 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.41 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>