213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4852 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
594 aa  1209    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  52.65 
 
 
570 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  51.57 
 
 
559 aa  552  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  47.71 
 
 
598 aa  535  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  44.62 
 
 
550 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  46.86 
 
 
553 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  42.17 
 
 
580 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  37.3 
 
 
545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.45 
 
 
544 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  31.39 
 
 
558 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  39.34 
 
 
325 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  40.19 
 
 
325 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  40.19 
 
 
325 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.46 
 
 
339 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  37.8 
 
 
343 aa  204  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.73 
 
 
339 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  37.95 
 
 
333 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  36.61 
 
 
343 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.67 
 
 
341 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  36.89 
 
 
325 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.9 
 
 
343 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  37.84 
 
 
339 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.91 
 
 
344 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  37.69 
 
 
346 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  37.16 
 
 
326 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  38.25 
 
 
339 aa  193  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.35 
 
 
338 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.12 
 
 
731 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  36.39 
 
 
339 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  36.01 
 
 
343 aa  189  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  33.83 
 
 
731 aa  186  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  33.43 
 
 
342 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.85 
 
 
350 aa  183  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  33.03 
 
 
727 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  36.5 
 
 
344 aa  183  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  36.76 
 
 
346 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.53 
 
 
330 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.01 
 
 
344 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  33.48 
 
 
525 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  35.01 
 
 
343 aa  178  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  35.91 
 
 
343 aa  177  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.62 
 
 
343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  34.41 
 
 
346 aa  174  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.77 
 
 
342 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.43 
 
 
343 aa  173  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  32.73 
 
 
334 aa  173  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.24 
 
 
350 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  34.23 
 
 
329 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  35.31 
 
 
343 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 
347 aa  165  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  34.72 
 
 
343 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.96 
 
 
343 aa  163  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  29.91 
 
 
336 aa  163  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  32.94 
 
 
336 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.83 
 
 
344 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.13 
 
 
334 aa  161  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  34.52 
 
 
343 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.16 
 
 
343 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  33.84 
 
 
344 aa  161  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 
347 aa  161  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.18 
 
 
342 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  31.38 
 
 
331 aa  158  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  33.63 
 
 
344 aa  157  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  37.19 
 
 
344 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.53 
 
 
343 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  39.92 
 
 
333 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.59 
 
 
333 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.82 
 
 
332 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.33 
 
 
330 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.03 
 
 
332 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  32.34 
 
 
323 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  31.21 
 
 
323 aa  135  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  28.57 
 
 
330 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.04 
 
 
330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  28.23 
 
 
333 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  28.95 
 
 
330 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.73 
 
 
331 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  32.1 
 
 
691 aa  130  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.62 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.77 
 
 
344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.58 
 
 
330 aa  129  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  28.62 
 
 
331 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  28.53 
 
 
331 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  38.58 
 
 
207 aa  126  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  26.73 
 
 
326 aa  125  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  29.35 
 
 
330 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  29.69 
 
 
330 aa  124  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  27.55 
 
 
333 aa  124  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  26.63 
 
 
330 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.33 
 
 
330 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  27.7 
 
 
330 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  27.21 
 
 
331 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  25.83 
 
 
331 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.43 
 
 
331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.07 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.9 
 
 
319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
329 aa  115  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.86 
 
 
333 aa  113  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.14 
 
 
328 aa  113  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.09 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>