157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1188 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
333 aa  684    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  85.59 
 
 
333 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  59.46 
 
 
330 aa  427  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  58.86 
 
 
330 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  59.88 
 
 
331 aa  425  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  57.66 
 
 
330 aa  421  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  57.96 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  60.66 
 
 
330 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  56.29 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.86 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  55.56 
 
 
331 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  56.16 
 
 
330 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.89 
 
 
331 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.4 
 
 
331 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.99 
 
 
331 aa  364  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  51.05 
 
 
330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.8 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.07 
 
 
319 aa  332  5e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  48.2 
 
 
326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  47.31 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  47.6 
 
 
330 aa  312  5.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.83 
 
 
321 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.73 
 
 
338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.25 
 
 
327 aa  305  7e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  45.81 
 
 
330 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.11 
 
 
333 aa  295  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  42.66 
 
 
360 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  42.44 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  41.49 
 
 
330 aa  272  7e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.62 
 
 
329 aa  271  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  49.23 
 
 
259 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  39.1 
 
 
330 aa  251  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  38.62 
 
 
331 aa  249  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.75 
 
 
328 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  41.67 
 
 
322 aa  247  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  42.25 
 
 
334 aa  247  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  40.91 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  39.7 
 
 
335 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  38.48 
 
 
321 aa  228  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  32.44 
 
 
332 aa  182  6e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.23 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  33.24 
 
 
332 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  32.44 
 
 
339 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  30.93 
 
 
326 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  32.54 
 
 
339 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  30.47 
 
 
545 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.7 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  30.23 
 
 
598 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.98 
 
 
350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  29.29 
 
 
326 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  29.49 
 
 
339 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.51 
 
 
343 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  28.92 
 
 
344 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.15 
 
 
343 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  28.06 
 
 
325 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  28.57 
 
 
346 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  30.07 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  30.07 
 
 
325 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.56 
 
 
338 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.11 
 
 
550 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.69 
 
 
570 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.33 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.39 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.12 
 
 
343 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.34 
 
 
344 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.39 
 
 
339 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  28.75 
 
 
525 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  24.92 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.7 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.2 
 
 
544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.47 
 
 
325 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  25.88 
 
 
346 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  28.01 
 
 
344 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  28.95 
 
 
346 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.99 
 
 
559 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  27.33 
 
 
343 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.6 
 
 
344 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  27.55 
 
 
594 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.65 
 
 
334 aa  123  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.33 
 
 
347 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.22 
 
 
341 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  25.9 
 
 
553 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  28.77 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.88 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  27.07 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  28.99 
 
 
343 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  29.3 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.06 
 
 
342 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  26.03 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  26.76 
 
 
343 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.67 
 
 
343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  26.26 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  26.55 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  26.72 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.71 
 
 
343 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  26.71 
 
 
342 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.29 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  26.85 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  26.41 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  28.48 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>