159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1633 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 346 aa  699    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  60.98 
 
 		 346 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  59.54 
 
 		 344 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.79 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  58.79 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  51.45 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  51.45 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  50.58 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.29 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  54.62 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  53.18 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  51 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.6 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  56.07 
 
 		 343 aa  359  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  49.13 
 
 		 343 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.72 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  50.29 
 
 		 343 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.84 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.29 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  49.71 
 
 		 343 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.4 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.59 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.37 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.61 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.02 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  45.32 
 
 		 344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  48.27 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  46.47 
 
 		 339 aa  297  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  46.47 
 
 		 339 aa  291  9e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.49 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  44.48 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  35.28 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  37.06 
 
 		 559 aa  202  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  35.69 
 
 		 598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.8 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.75 
 
 		 550 aa  188  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  35.76 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  35.44 
 
 		 553 aa  185  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  31.95 
 
 		 545 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  36.76 
 
 		 594 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.04 
 
 		 570 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.9 
 
 		 580 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.65 
 
 		 544 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.82 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  33.13 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.44 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  32.54 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.79 
 
 		 347 aa  166  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  32.07 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  32.54 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.76 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  36 
 
 		 525 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  31.9 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  31.34 
 
 		 727 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.61 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  30.41 
 
 		 731 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.81 
 
 		 731 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.05 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.39 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.57 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.09 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  27.38 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  28.83 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.98 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.43 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  33.21 
 
 		 558 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  30.12 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.01 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  29.93 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.85 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  25.66 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  24.93 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.2 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  25.88 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  29.41 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  28.53 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  28.23 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  25.29 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  27.76 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  25.51 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.36 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.57 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  31.27 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.77 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.24 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  26.47 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  26.13 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  24.62 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  23.89 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  33.67 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.78 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.94 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.45 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.53 
 
 		 331 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  22.81 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  24.71 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.83 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.28 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.17 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.73 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>