158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1477 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
339 aa  674    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  89.68 
 
 
339 aa  610  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.46 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  51.03 
 
 
344 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  51.18 
 
 
344 aa  334  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.6 
 
 
342 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.33 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.41 
 
 
343 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.65 
 
 
343 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.87 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.91 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  46.78 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.66 
 
 
341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  45.61 
 
 
343 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.12 
 
 
342 aa  309  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  46.49 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  48.07 
 
 
344 aa  298  7e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  49.11 
 
 
343 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.1 
 
 
344 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  47.94 
 
 
346 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  46.47 
 
 
346 aa  291  9e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  45.27 
 
 
343 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.48 
 
 
343 aa  288  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  43.99 
 
 
343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  45.69 
 
 
346 aa  282  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  43.7 
 
 
342 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  41.64 
 
 
343 aa  278  7e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.6 
 
 
344 aa  278  7e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  43.7 
 
 
343 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  45.77 
 
 
344 aa  276  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.25 
 
 
343 aa  258  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.24 
 
 
344 aa  249  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  40.84 
 
 
598 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  40.65 
 
 
559 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  40.06 
 
 
570 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  38.14 
 
 
545 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  39.36 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.01 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.24 
 
 
550 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  37.05 
 
 
553 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  38.17 
 
 
326 aa  198  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.39 
 
 
339 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  41.35 
 
 
525 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  34.93 
 
 
333 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.72 
 
 
544 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  38.25 
 
 
594 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.94 
 
 
334 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  37.01 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  37.01 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.3 
 
 
347 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.33 
 
 
580 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.15 
 
 
350 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  38.67 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  34.81 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.06 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  32.14 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.38 
 
 
331 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  33.53 
 
 
331 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.7 
 
 
731 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  33.94 
 
 
325 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  32.54 
 
 
333 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.93 
 
 
347 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  30.84 
 
 
731 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.04 
 
 
330 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  30.51 
 
 
334 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  34.43 
 
 
330 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  34.21 
 
 
727 aa  153  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  31.76 
 
 
336 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  31.75 
 
 
336 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  36.05 
 
 
329 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  32.08 
 
 
330 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.21 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.09 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.04 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
337 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  32.78 
 
 
558 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  36.63 
 
 
323 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.62 
 
 
331 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  36.54 
 
 
371 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  29.55 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.16 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.8 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.96 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.35 
 
 
331 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.37 
 
 
338 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  29.81 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  27.54 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  28.19 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.63 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  26.56 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  29.85 
 
 
326 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  34.1 
 
 
336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  27.76 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  28.79 
 
 
331 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  29.25 
 
 
330 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.58 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.71 
 
 
337 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  26.67 
 
 
330 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.12 
 
 
330 aa  122  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.87 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>