174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0151 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
336 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.73 
 
 
339 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  35.96 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.86 
 
 
339 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.88 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  33.23 
 
 
545 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.36 
 
 
343 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  32.94 
 
 
334 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34.42 
 
 
553 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  31.2 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.24 
 
 
570 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  34.4 
 
 
325 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  36.34 
 
 
525 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  31.78 
 
 
727 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.29 
 
 
550 aa  165  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.88 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  33.04 
 
 
325 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  33.04 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.65 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  32.94 
 
 
594 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.75 
 
 
350 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.59 
 
 
332 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.62 
 
 
344 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  32.54 
 
 
598 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  30.5 
 
 
344 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.81 
 
 
731 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.72 
 
 
332 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.67 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.83 
 
 
580 aa  155  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.75 
 
 
559 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  30.41 
 
 
346 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.16 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  30.14 
 
 
731 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.64 
 
 
544 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  31.76 
 
 
344 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  31.16 
 
 
339 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.45 
 
 
334 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  31.75 
 
 
339 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.94 
 
 
344 aa  149  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  29.41 
 
 
343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.63 
 
 
331 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  35 
 
 
326 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  28.57 
 
 
343 aa  142  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.91 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  33.14 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.03 
 
 
343 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.78 
 
 
344 aa  136  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  31.85 
 
 
343 aa  136  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  27.78 
 
 
343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  29.03 
 
 
333 aa  136  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.78 
 
 
343 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.09 
 
 
342 aa  135  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.73 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.22 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  30.88 
 
 
371 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  27.22 
 
 
331 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  31.3 
 
 
337 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  29.51 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  35.21 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  27.54 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  30.12 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  32.35 
 
 
558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.75 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.24 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.53 
 
 
338 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  30.97 
 
 
336 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  27.11 
 
 
343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.89 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  28.28 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.15 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  30.03 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  30.36 
 
 
691 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  34.63 
 
 
323 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  27.54 
 
 
343 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.41 
 
 
347 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  34.32 
 
 
329 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.7 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  30.61 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.3 
 
 
337 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.85 
 
 
320 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.46 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.19 
 
 
326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  29.67 
 
 
330 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.38 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  22.67 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  25.76 
 
 
338 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.19 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  24.92 
 
 
330 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  26.87 
 
 
331 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.63 
 
 
329 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.89 
 
 
330 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.7 
 
 
347 aa  106  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  32.67 
 
 
207 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.42 
 
 
330 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  29.71 
 
 
330 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.25 
 
 
331 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  25.42 
 
 
330 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.92 
 
 
334 aa  103  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.42 
 
 
328 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>