152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0541 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 330 aa  678    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  67.88 
 
 		 330 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  66.67 
 
 		 330 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  65.56 
 
 		 331 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  58.86 
 
 		 333 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  57.66 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.18 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  55.29 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  58.48 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  56.93 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  56.06 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.57 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  54.38 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.13 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  50.91 
 
 		 330 aa  362  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  50.61 
 
 		 330 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.9 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.16 
 
 		 319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  50.45 
 
 		 330 aa  331  9e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.34 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  46.83 
 
 		 326 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.24 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  46.39 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.21 
 
 		 333 aa  286  5e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.41 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  43.33 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  42.97 
 
 		 384 aa  279  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.67 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  41.31 
 
 		 360 aa  268  8e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  39.58 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.61 
 
 		 328 aa  255  9e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  41.41 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  40.49 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  38.07 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  48.08 
 
 		 259 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  39.1 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  39.75 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  38.84 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  35.15 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  37.28 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  35.52 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.33 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  30.51 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  32.34 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  30.03 
 
 		 545 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  28.06 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  28.96 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  29.08 
 
 		 598 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.73 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.41 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.89 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.86 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  26.13 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  29.86 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  27.08 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.08 
 
 		 544 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  29.68 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.43 
 
 		 550 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  28.2 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  29.33 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.78 
 
 		 342 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.76 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  27.33 
 
 		 594 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.73 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.73 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.97 
 
 		 570 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.54 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  28.62 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.3 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.98 
 
 		 559 aa  119  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  27.68 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  26.06 
 
 		 553 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.04 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  27.36 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.49 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.09 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.04 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.07 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  27.54 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  24.56 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  27.68 
 
 		 343 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  26.8 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  25.86 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.84 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.24 
 
 		 558 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.92 
 
 		 347 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  25.29 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.81 
 
 		 580 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.2 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  27.31 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  26.81 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.26 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.71 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  25.51 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  24.48 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.92 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.21 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.51 
 
 		 731 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  26.42 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  25.85 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>